A fauna da Escócia é geralmente típica da região noroeste da Europa pertencente ao reino Paleárctico, embora vários dos grandes mamíferos do país tenham sido caçados até à extinção em tempos históricos, e a atividade humana também tenha levado à introdução de diversas espécies da fauna. Os variados ambientes temperados da Escócia sustentam 62 espécies de mamíferos selvagens, incluindo uma população de gato selvagem escocês, números importantes de foca cinzentas e foca de portos e a colônia mais setentrional de golfinho nariz‐de‐garrafas do mundo.Matthews (1968) p. 254.

Muitas populações de aves das charnecas – incluindo o tetrao negro e o tetrao vermelho – habitam a região, e o país dispõe de áreas de nidificação de importância internacional para aves marinhas, como a gaivota-do-norte.Fraser Darling and Boyd (1969) pp. 7, 98–102. A águia-dourada tornou-se um ícone nacional,Benvie (1994) p. 12. e as águia-de-cauda-brancas e as águia-pescadoras recolonizaram recentemente o território. O bico-cruzado escocês é a única espécie de vertebrado endêmico do Reino Unido.Em tempos passados, essa afirmação foi feita para outras espécies, como o tetrao vermelho (hoje considerado uma subespécie do tetrao do salgueiro) e a doninha irlandesa (Mustela erminea hibernica), também hoje considerada subespécie da doninha. A posição de Loxia scotica como espécie verdadeira é objeto de debate, mas o consenso atual é de que ela possui esse status (ver, por exemplo, Miles e Jackman (1991) pp. 21–30 e Benvie (2004) p. 55.) A posição do peixe de água doce conhecido como vendace Coregonus vandesius é controversa, com muitas autoridades considerando-o sinônimo de Coregonus albula.Adams, William Mark (2003) Future Nature. Associação Britânica de Conservacionistas da Natureza p. 30. Recuperado em 14 de julho de 2009. Esta fonte lista as espécies endêmicas do Reino Unido como "14 líquenes, 14 briófitas, 1 samambaia, 21 plantas superiores, 16 invertebrados e 1 vertebrado (o bico-cruzado escocês)."Possivelmente, porque vertebrados endêmicos estão quase ausentes no Reino Unido, nem a SNH nem o JNCC parecem fornecer uma “lista” definitiva, mas é claro que o bico-cruzado escocês é a única ave endêmica (Gooders (1994) p. 273 e "Bico-cruzado escocês: Loxia scotica" (pdf) JNCC. Recuperado em 7 de julho de 2009.) e que não há peixes de água doce endêmicos (Maitland, P. e Lyle A.A. (1996) "Peixes de água doce ameaçados da Grã-Bretanha" em Kirchofer, A. e Hefti, D. (1996) Conservação de Peixes de Água Doce Ameaçados na Europa. Basel. Birkhäuser.) ou mamíferos ("Lista dos Mamíferos Britânicos" ppne.co.uk. Recuperado em 7 de julho de 2009.) na Grã-Bretanha. Existem anfíbios e répteis nativos em número tão pequeno que não há dúvidas quanto à ausência de espécies endêmicas. Essa posição é implícita, embora não declarada pela SNH em sua Nota de Informação e Consultoria Número 49 "Espécies prioritárias na Escócia: animais" Recuperado em 7 de julho de 2009. Ver também Myers, Norman (2003) "Conservação da Biodiversidade: Como Estamos?" (pdf) The Environmentalist 23 pp. 9–15. Recuperado em 7 de julho de 2009. Esta publicação confirma que há apenas uma "espécie de vertebrado não-peixe endêmica" nas Ilhas Britânicas, embora não identifique qual seja a espécie.

As águas costeiras da Escócia estão entre as mais produtivas biologicamente do mundo; estima-se que o número total de espécies marinhas escocesas supere 40.000. Os Montículos Darwin são uma área importante de recifes de corais de águas profundas frias descobertos em 1998. No interior, quase 400 populações geneticamente distintas de salmão do Atlântico vivem nos rios escoceses. Das 42 espécies de peixes encontradas nas águas doces do país, metade chegou por colonização natural e a outra metade por introdução humana.

Somente seis anfíbios e quatro répteis terrestres são nativos da Escócia, mas muitas espécies de invertebrados que vivem ali são, de outra forma, raras no Reino Unido.Miles and Jackman (1991) p. 48. Estima-se que 14.000 espécies de insetos, incluindo abelhas e borboletas raras protegidas por planos de ação para a conservação, habitem a Escócia. Agências de conservação no Reino Unido estão preocupadas que as mudanças climáticas, especialmente seus potenciais efeitos sobre os platôs montanhosos e a vida marinha, ameacem boa parte da fauna escocesa.Ver, por exemplo, Johnston, I. (29 November 2006) "Mudança nos Mares com o Norte: o plâncton se desloca". Edimburgo. The Scotsman. Este relatório cita a preocupação de James Lovelock de que o aquecimento global “matará bilhões” de pessoas no próximo século.

Habitat

A Escócia desfruta de variados ambientes temperados, que englobam bosques folhosos e coníferos, bem como áreas de charneca, montanhoso, estuário, água doce, oceânico e tundra. Cerca de 14% da Escócia é coberta por florestas – em sua maioria plantações florestais – mas antes da intervenção humana, o território abrigava vastas florestas Caledonianas e bosques de folhosas largas.Embora ninguém negue que as florestas antigas eram muito maiores, há divergências quanto ao momento e às causas dessa redução. Muitos autores, desde o autor do século XVI Héctor Boece até o naturalista do século XX Frank Fraser Darling, acreditavam que as florestas eram muito mais extensas na época romana do que hoje. Contudo, hoje se entende que o desmatamento das Colinas do Sul, causado pelo clima e pelos homens, já estava em curso quando as legiões chegaram. Ver Smout (2007) pp. 20–32. Embora bastante reduzidos, ainda restam remanescentes significativos dos bosques nativos de Pinheiro Escocês. Dezessete por cento da Escócia é coberta por charnecas de Ericaceae e turfeiras. Caithness e Sutherland possuem uma das maiores e mais intactas áreas mundiais de turfa de manta, que sustenta uma comunidade singular de vida selvagem. Setenta e cinco por cento do território escocês é classificado como agrícola (incluindo áreas de charneca), enquanto as áreas urbanas representam cerca de 3%. A costa tem de extensão, e o número de ilhas com vegetação terrestre chega a quase 800 – aproximadamente 600 situadas na costa oeste. A Escócia detém mais de 90% do volume e 70% da área total de água doce do Reino Unido. Existem mais de 30.000 lochs de água doce e 6.600 sistemas fluviais.

Sob os auspícios da União Europeia e de sua Diretiva Habitats, 244 sítios na Escócia, abrangendo mais de , foram reconhecidos pela Comissão Europeia como Áreas Especiais de Conservação (SAC)."SACs na Escócia" Joint Nature Conservation Committee. Recuperado em 29 de setembro de 2018. Citando o Scottish Office. (1998). People and nature. A new approach to SSSI designations in Scotland. The Scottish Office, Edimburgo. Recuperado em 2 January 2007. As águas costeiras da Escócia estão entre as mais produtivas biologicamente do mundo, abrigando 40.000 ou mais espécies. Vinte e quatro dos SACs são sítios marinhos, e outros nove são costeiros, contendo elementos marinhos e não marinhos. Esses elementos marinhos se estendem por uma área de aproximadamente . Os Montículos Darwin, cobrindo cerca de , estão sendo considerados como o primeiro SAC offshore."Offshore" neste contexto significa sem incorporar qualquer terra.

Mamíferos A Escócia foi completamente coberta de gelo durante as Pleistocenos de glaciação.Exceto pelo enclave atlântico de St Kilda. Maclean (1972) p. 20. À medida que o clima pós-glacial se aqueceu e o gelo recuou, os mamíferos migraram pela paisagem. Contudo, a abertura do Canal da Mancha (com o aumento do nível do mar) impediu novas migrações, de modo que a Grã-Bretanha continental possui apenas dois terços das espécies que alcançaram a Escandinávia, enquanto as ilhas Hébridas a oeste da Escócia possuem apenas metade dessas espécies.Murray (1973) p. 72. Sessenta e duas espécies de mamíferos vivem de forma selvagem na Escócia e arredores, incluindo 13 espécies encontradas em águas costeiras. Acredita-se que as populações de um terço das espécies de mamíferos terrestres estejam em declínio devido a fatores como poluição ambiental, fragmentação de habitats, mudanças nas práticas agrícolas – especialmente o sobrepastoreio – e competição com espécies introduzidas. Nenhuma espécie de mamífero é exclusiva da Escócia, embora o camundongo de campo de St Kilda (Apodemus sylvaticus hirtensi) seja uma subespécie endêmica do camundongo que chega a ter o dobro do tamanho dos seus congêneres continentais,Benvie (2004) p. 645. e a campagnola de Orkney (Microtus arvalis orcadensis), encontrada apenas no arquipélago de Orkney, é uma subespécie do campagnola comum. Pode ter sido introduzida por colonizadores primitivos há cerca de 4.000 anos. Existem diversas raças notáveis de mamíferos domesticados de origem escocesa, incluindo o gado das Terras Altas, o pônei de Shetland, o pônei de Eriskay, a ovelha Soay e o terrier escocês.

Carnívoros

A representação da família dos mustelídeos na Escócia é típica de toda a Grã-Bretanha, com a ressalva de que o furão-europeu está ausente e que a Escócia é o reduto dos marta-do-pinho,Corbet and Ovenden (1984) pp. 180–86. embora a pureza desta espécie esteja ameaçada pela libertação de marta americanas no norte da Inglaterra.Benvie (2004) p. 48. A Escócia abriga as únicas populações do gato selvagem escocês nas Ilhas Britânicas, com números estimados entre 400 e 2.000 animais, e da subespécie da raposa vermelha Vulpes vulpes vulpes, uma raça maior que a mais comum V. v. crucigera e que apresenta duas formas distintas.Matthews (1968) pp. 231–32. O gato selvagem encontra-se em risco devido à inadequação da legislação protetiva e é atualmente considerado seriamente ameaçado de extinção.Benvie (2004) p. 18.Hull (2007) pp. 184–89. Em 2013, foi anunciado que a ilha de Càrna passaria a oferecer um santuário e uma estação de reprodução para proteger a espécie."Plano em ilha remota para ajudar a salvar os gatos selvagens escoceses da extinção". (23 de setembro de 2013) Glasgow. The Herald. Recuperado em 25 de setembro de 2013. Foram realizadas campanhas de extermínio da população de vison americano selvagens – trazidos para a Grã-Bretanha para a indústria de peles na década de 1950 – sob os auspícios do Projeto dos Visons das Hébridas e da Iniciativa Escocesa para os Visons, que esperam criar uma zona livre de visons em uma vasta área que se estende de Wester Ross a Tayside.Haworth, Jenny (3 February 2009) "A eliminação nacional pode exterminar os visons do Reino Unido". Edimburgo. The Scotsman.Ross, John (12 May 2011) "Grupos de Vida Selvagem concordam com plano de £1 milhão para eliminar a incômoda presença dos visons americanos". Edimburgo. The Scotsman.

Roedores, insetívoros e lagomorfos