Subgenul Colacovirus este un subgen de coronavirusuri din genul Alphacoronavirus care include oficial o singură specie numită coronavirusul CDPHE15 al liliecilor (Bat coronavirus CDPHE15), cu două tulpini virale numite CDPHE15/USA/2006 și coronavirusul Myotis lucifugus (Myl-CoV), care au o identitate nucleotidică de 98,2% în întregul genom.Bat coronavirus CDPHE15. NCBI taxonomy databaseDecaro, N., Lorusso, A. (2020). Novel human coronavirus (SARS-CoV-2): A lesson from animal coronaviruses. Veterinary Microbiology, Volume 244, May 2020, 108693
Ambele tulpini virale au fost identificate la liliacul mic brun (Myotis lucifugus) (familia Vespertilionidae), cunoscut și sub numele de liliacul mic brun nord-american. Prima tulpină, CDPHE15/USA/2006, a fost identificată în 2006 în statul Colorado, SUA (GenBank ID = KF430219Bat coronavirus CDPHE15/USA/2006, complete genome. GenBank: KF430219.1Strain Details for Bat coronavirus CDPHE15 Strain bat/USA/CDPHE15/2006. Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR)), iar a doua tulpină, Myotis lucifugus CoV (Myl-CoV), a fost identificată în 2010 în Canada (GenBank ID = KY799179.1Myotis lucifugus coronavirus, complete genome. GenBank: KY799179.1Strain Details for Bat coronavirus CDPHE15 Strain UNKNOWN-KY799179. Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR)).
Coronavirusul CDPHE15 a fost găsit în intestinele și plămânii liliacului mic brun și este asociat cu o patologie sau inflamație minimă.S. Subudhi, N. Rapin, T.K. Bollinger, J.E. Hill, M.E. Donaldson, C.M. Davy, L. Warnecke, J.M. Turner, C.J. Kyle, C.K.R. Willis, V. Misra. A persistently infecting coronavirus in hibernating Myotis lucifugus, the North American little brown bat. Journal of General Virology Volume 98, Issue 9 (2017), pp. 2297-2309 Coronavirusul CDPHE15 nu este zoonotic, adică nu se transmite la om.Helmy YA, Fawzy M, Elaswad A, Sobieh A, Kenney SP, Shehata AA. The COVID-19 pandemic: a comprehensive review of taxonomy, genetics, epidemiology, diagnosis, treatment, and control. J Clin Med 2020; 9(4):E1225-E1225.
Referințe
Categorie:Alphacoronavirus