Гаплогруппа L0 — в популяционной генетике — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Гаплогруппа L0 является одной из двух ветвей от самого последнего общего предка (MRCA) для общей материнской линии человека. Гаплогруппа L0 состоит из пяти основных ветвей (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Четыре из них были первоначально классифицированы в клады L1 как L1a, L1d, L1f и L1K.

Разделение линий L0 и L1′2′3 произошло 124 тыс. л. н. (95% доверительный интервал — 151—97 тыс. л. н.)Emily H. M. Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitry Pushkarev, Denis Khokhrin, Dmitry Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska, Anton Valouev. Reconstructing Genetic History of Siberian and Northeastern European Populations, 2015. В 2019 году генетики рассчитали, что линия L0 возникла в пределах остаточного палео-водно-болотного массива Макгадикгади-Окаванго на юге Африки приблизительно 200 тыс. л. н. (95% доверительный интервал — 240—165 тыс. л. н.)Eva K. F. Chan et al. Human origins in a southern African palaeo-wetland and first migrations, 2019.

У малавийских образцов определены субклады L0k2 (10000—5000 л. н.), L0a2 (7230 л. н.), L0f (Fingira, 2400 л. н.) — все с горы Хора (Hora), L0k2 (5400—4800 л. н.) и L0k1 (4525 л. н.) из скального укрытия Ченчерере-2 (Chencherere II), L0d1c (5290 л. н.) и L0d1b2b (5270 л. н.) из Fingira.

У образцов 2/SEII (7970—7800 л. н.) и 2/SEI (7920—7690 л. н.) из местонахождения в Камеруне определена митохондриальная гаплогруппа L0a2a1Mark Lipson et al. Ancient West African foragers in the context of African population history , 2020.

L0f1 определили у образца LUK003 с холма Лукенья (Lukenya Hill) в Кении (3500 лет до настоящего времени, неолит).

L0f2b определили у образца I3706 (Baqah_MLBA, 1424—1288 лет до н. э.) из пещеры B3 (Cave B3) в долине Бакаа (Baq҅ah Valley) в 20 км к северо-западу от Аммана (бронзовый век Иордании), секвенировав ДНК из височной костиLily Agranat-Tamir et al. The Genomic History of the Bronze Age Southern Levant , May 28, 2020 (Table S1. Overview of the 73 Individuals Newly Reported in this Study, Related to Figure 1).

В 2014 году у образца возрастом 2330 лет из Южной Африки (St Helena Bay) определили субветвь L0d2c1c.

В 2016 году у мумии из региона Тули на севере Ботсваны (поздний железный век) выявили митохондриальную гаплогруппу L0.

В 2017 году у трёх человек каменного века (Ballito Bay A, Ballito Bay B и Doonside), живших ок. 2 тыс. л. н., и одного человека железного века из замка Шампань (Champagne Castle), жившей 448—282 л. н., определили линию L0d2Carina M. Schlebusch et al.Ancient genomes from southern Africa pushes modern human divergence beyond 260,000 years ago, 2017.

В 2017 году у южноафриканского образца I9133 из Faraoskop Rock Shelter возрастом 2000 л. н. определили субклад L0d1b2b1b, у образца I9134 из Kasteelberg возрастом 1310 л. н. определили субклад L0d1a1a (некалиброванные даты). Субклада L0a определена у танзанийского образца из Пембы (I1048) возрастом 1520 лет назадPontus Skoglund et al. Reconstructing Prehistoric African Population Structure , 21 September 2017.

L0a2 (скорее всего) определили у кенийского образца I8931 (White Rock Point (GrJb2), южный берег залива Уинам (Winam Gulf) озера Виктория) из позднего каменного века (Later Stone Age, N/A), L0a определена у танзанийского образца I13981 (Gishimangeda Cave, Pastoral_Neolithic (other), 2730—2460 л. н.), L0a2d определена у кенийского образца I8758 (Naishi Rockshelter, Pastoral_Neolithic (other), 2700—2370 л. н.), L0f2a1 определена у танзанийского образца I13977 (Gishimangeda Cave, Pastoral_Neolithic (other), 2000—1890 л. н.), L0a1d определена у кенийского образца I8805 (Egerton Cave (GrJh10), Pastoral_Neolithic (Elmenteitan), 1870—1740 л. н.), L0f2a определена у кенийского образца I8892 (Ilkek Mounds/Ilkek II (Gilgil) (GsJj66), Pastoral Iron Age, 1170—980 л. н.), L0a1c1 определена у кенийского образца I12381 (Laikipia District Burial Site (GoJl45), Pastoral Iron Age, 650—560 л. н.)Mary E. Prendergast et al. Ancient DNA reveals a multistep spread of the first herders into sub-Saharan Africa (Table S7. (separate file) mtDNA haplogroups), 2019.

L0k1a2 определили у образца XAR002 из Xaro (1400 л. н., ранний железный век) в Ботсване, L0d3b1 обнаружена у образца TAU001 из Taukome (1100 л. н., ранний железный век) в Ботсване, L0a1b1a1 обнаружена у образца KIN004 из Kindoki (230 лет до настоящего времени, 1636—1800 гг.) в Демократической Республике КонгоKe Wang et al. Ancient genomes reveal complex patterns of population movement, interaction, and replacement in sub-Saharan Africa // Science Advances, 12 Jun 2020.

L0a1a1 определена у образцов с христианского кладбища R (∼650—1000 гг.) на острове (Кульб) в Северном СуданеKendra A. Sirak et al. Social stratification without genetic differentiation at the site of Kulubnarti in Christian Period Nubia , February 17, 2021 (Supplementary Figure 5, 6 ).

L0 определили у мужчины с афроамериканского кладбища (1774—1850 гг., Y-хромосомная гаплогруппа A1b) в МэрилендеÉADAOIN HARNEY et al. The genetic legacy of African Americans from Catoctin Furnace // SCIENCE, 4 Aug 2023.

Установлено, что чаще всего гаплогруппа L0 встречается в странах Африки к югу от Сахары. Она достигает своей наивысшей частоты у койсанских народов (73 %), достигая в Намибии (!Xun) 79 %, ЮАР (Khwe/!Xun) 83 % и Ботсване (!Xun) 100 %.

При изучении митохондриальных геномов в группе койсанов Бехар (Behar) и др. в 2008 году обнаружили, что древние геномы койсанов ограничивались митохондриальными гаплогруппами L0d и L0k, по их оценке ранней митохондриальной ветви L0k, возникших приблизительно 144 000 лет назад, что составляет около 3/4 времени появления ближайшего митохондриального родственника (митохондриальной Евы). Другие оценки относят ответвление митохондриальной линии L0k к периоду между 120 000 и 160 000 лет назад. Расхождение гаплогрупп L0d и L0a'b'f'k произошло ~ 119 000 (100 100–138 200) лет назад, расхождение гаплогрупп L0k и L0a'b'f произошло ~ 98 700 лет (от 82 300 до 115 400) лет назад, расхождение L0a произошло 42 400 (33 000–52 000) лет назадDaniel Shriner et al. Genetic Ancestry of Hadza and Sandawe Peoples Reveals Ancient Population Structure in Africa , Genome Biology and Evolution, Volume 10, Issue 3, 1 March 2018, Pages 875–882, 14 March 2018.

Приведённое ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена и Манфреда Кайзера и последующих опубликованных исследованиях.

Митохондриальная Ева (MRCA) L0 L0d L0d3 L0d1’2 L0d1 L0d1a L0d1b L0d1c L0d1c1 L0d2 L0d2a’b L0d2a L0d2a1 L0d2b L0d2c L0d2c1cAlan G. Morris et al. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African L0a’b'f’k L0k L0k1 L0k2 L0a’b'f L0f L0f1 L0f2 L0f2a L0f2b L0a’b L0a L0a1 L0a1a L0a1a2 L0a1b L0a1b1 L0a1b1a L0a1b2 L0a1c L0a1d L0a2 L0a2a L0a2a1 L0a2a1a L0a2a1a1 L0a2a1a2 L0a2a2 L0a2a2a L0a2b L0a2ba L0a2c L0a2d L0a3 L0a4 L0b

Примечания

См. также

Ссылки

Общие сведения Ian Logan’s Mitochondrial DNA Site PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree L0 L0 YFull MTree 1.02.19455 (under construction)

Гаплогруппа L3

Категория:Гаплогруппа L (мтДНК)