Метод Trim-Away — это метод быстрой принудительной высокоизбирательной (селективной) деградации эндогенных белков в клетках млекопитающих, который не требует предварительной модификации генома или матричной РНК. Поскольку избирательность метода Trim-Away основана на использовании антител, его можно применять к широкому спектру белков-мишеней с использованием готовых моноклональных антител. Trim-Away позволяет исследовать функцию белка в самых разных типах клеток How to destroy any protein in any cell . ScienceDaily, 16 November 2017, Max-Planck-Gesellschaft.. Разработан под началом Мелины Шух в сотрудничестве с Dean Clift.
Принцип действия В основе метода лежит использование лигазы убиквитина - TRIM21, которая связывается с высоким сродством с доменом кристаллизующегося фрагмента иммуноглобулина Fc антител. Во время заражения TRIM21 транспортирует систему убиквитин-протеасом к связанным с антителом патогенам, что приводит к их разрушению. Разработаны многочисленные модификации этого методаRöth, S., Fulcher, L. J., & Sapkota, G. P. (2019). Advances in targeted degradation of endogenous proteins. Cellular and Molecular Life Sciences, 76(14), 2761–2777 .
PROTAC Широкое распространение получили также методы PROTAC (PROteolysis TArgeting Chimeras) использующие гетеробифункциональные молекулы, которые соединяют белок подлежащий удалению с E3 убиквитин-лигазойSun, X., Gao, H., Yang, Y., He, M., Wu, Y., Song, Y., ... & Rao, Y. (2019). PROTACs: great opportunities for academia and industry. Signal Transduction and Targeted Therapy, 4, 64(2019). Gao, H., Sun, X., & Rao, Y. (2020). PROTAC Technology: Opportunities and Challenges. ACS Medicinal Chemistry Letters, 11(3), 237-240. https://doi.org/10.1021/acsmedchemlett.9b00597.
Примечания
Категория:Генетическая инженерия Категория:Методы молекулярной биологии