Якубенко — украинская фамилия.
Известные носители Якубенко, Александр Владимирович (1917—2000) — русский советский детский писатель и врач. Якубенко, Анатолий Владимирович (род. 1959) — советский и белорусский баскетболист и тренер. Якубенко, Виктор Сергеевич (род. 1940) — советский хозяйственный и государственный деятель. Якубенко, Евгений Андреевич (1935—?) — токарь, Герой Социалистического Труда. Якубенко, Ирина Вениаминовна (род. 1980) — российская актриса театра и кино, театральный режиссёр, педагог.