Гаплогруппа D (мтДНК)

Гаплогруппа D — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

И. А. Захаров-Гезехус с коллегами предложили дать гаплогруппе имя Дарый (Daryy)Захаров И. А. Центральноазиатское происхождение предков первых американцев // Первые американцы. 2003. № 11. С. 139-144..

Происхождение Предполагается, что гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет тому назад. Она является потомком гаплогруппы M.

По оценке Н. В. Володько, митохондриальная гаплогруппа D4h3 возникла на Дальнем Востоке около 17 тыс. лет назадВасильев С. А., Березкин Ю. Е., Козинцев А. Г., Пейрос И. И., Слободин С. Б., Табарев А. В. Заселение человеком Нового Света: Опыт комплексного исследования . СПб: Нестор-история, 2015.Volodko N. V., Starikovskaya E. B., Mazunin I. O. et al., 2008. Mitochondrial diversity in Arctic Siberians, with particular reference to the evolutionary history of Beringia and Pleistocenic peopling of the Americas // American Journal of Human Genetics. Vol. 82. № 5. P. 1084–1100..

Филогенетическое дерево D D4 D1 D1a D1b D1c D1d D4a D4a1 D4a1a D4a1b D4a1c D4a2 D4a2a D4a3 D4a3a D4a4 D4b D4b1 D3 D4b1a D4b1a1 D4b1a2 D4b1a2a D4b1a2a1 D4b1a2a1a D4b1b D4b1b1 D4b1b1a D4b1b2 D4b2 D4b2a D4b2a1 D4b2a2 D4b2a2a D4b2a2b D4b2b D4b2b1 D4b2b1a D4b2b1b D4b2b2 D4b2b3 D4c D4c1 D4c1a D4c1a1 D4c1b D4c1b1 D4c2 D4d D4e D4e1 D2 D2a D2a1 D2a1a D2a1b D2b D4e1a D4e1a1 D4e1a2 D4e2 D4e2a D4e2b D4e2c D4f D4g D4g1 D4g1a D4g1b D4g1c D4g2 D4g2a D4g2a1 D4h D4h1 D4h1a D4h3 D4i D4i1 D4i2 D4j D4k D4l D4l1 D4l2 D4l2a D4m D4m1 D4m2 D4n D4n1 D4o D4o1 D4o2 D5’6 D5 D5a’b D5a D5a1 D5a1a D5a2 D5a2a D5a2a1 D5a2a1a D5a2a1b D5b D5b1 D5b1a D5b1b D5b1b1 D5b2 D5c D5d D5d1 D6

Распространение Встречается в Северо-Восточной Азии (в том числе в Сибири). Также является одной из 5 мтДНК-гаплогрупп, обнаруженных у коренных народов АмерикиNatalia V. Volodko, Elena B. Starikovskaya, Ilya O. Mazunin et al., «Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas», The American Journal of Human Genetics 82, 1084—1100, May 2008. DOI 10.1016/j.ajhg.2008.03.019., наряду с такими, как A, B, C и X2a. D1 это базальная ветвь D4, которая широко распространена и разнообразна в Северной и Южной Америке. Субклады D4b1, D4e1 и D4h встречаются как в Азии, так и в Северной и Южной Америке. D2, встречается с высокой частотой в некоторых арктических и субарктических популяциях (особенно у алеутов) и является подклассом D4e1, параллельным D4e1a и D4e1c, поэтому его правильно следует называть D4e1b. D3 был найден главным образом в некоторых сибирских популяциях и у эскимосов Канады и Гренландии и является ветвью D4b1c. D4m2a* (D4m2a4) определили у нивхов (гиляков)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3861515.

Также гаплогруппа D довольно часто встречается в Центральной Азии<ref>D. Comas et al. [http://www.nature.com/ejhg/journal/v12/n6/full/5201160a.html Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages. European Journal of Human Genetics] , 2004</ref>, где она является второй по частоте кладой мтДНК (после митохондриальной гаплогруппы H). С низкой частотой гаплогруппа D встречается на северо-востоке Европы и в Юго-Западной Азии.

У монголов Китая митохондриальная гаплогруппа D достигает 27,07 %, у китайцев-хань — 23,53 %, у монголоязычных дауров — 10,53 %. Митохондриальная гаплогруппа D выявлена у 3 из 10 изученных в Китае носителей тунгусского языкаGuanglin He et al. Genomic insights into the differentiated population admixture structure and demographic history of North East Asians , July 20, 2021 (PDF ).

Палеогенетика D1 определена у девочки-подростка из пещеры Хойо Негро (полуостров Юкатан), жившей 13—12 тыс. лет назад D4h3a определена у мальчика Анзик-1 (:en:Anzick-1), жившего 12,7 тыс. лет назадRasmussen M. et al. The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana, Nature. 2014. V. 506. P. 225—229. D1 определили у 10 600-летней (AHUR_2064), из штата НевадаJ. Víctor Moreno-Mayar et al. Early human dispersals within the Americas , 2018 В Южном конусе Южной Америки в раннем голоцене была распространена митохондриальная гаплогруппа D1j, в среднем голоцене — митохондриальная гаплогруппа D1gRoca-Rada Xavier et al. Ancient mitochondrial genomes from the Argentinian Pampas inform the peopling of the Southern Cone of South America // ISBA9 (PDF D1j определили у образца LLP.S2.E1 (Laguna Chica, 10 223—9764 л. н.) из Аргентины D4h3 определена у индивида Шука Каа (Shuká Káa) из пещеры «На коленях» (:en:On Your Knees Cave) на острове принца Уэльского на юго-востоке штата Аляска, жившего 9730±60 — 9880±50 лет назадKemp Brian M. et al. (2007). Genetic Analysis of Early Holocene Skeletal Remains From Alaska and its Implications for the Settlement of the Americas D4h3a определили у образцов из бразильских Lapa do Santo возрастом ок. 9,5 тыс. л. н., Moraes возрастом ок. 5,8 тыс. л. н. и у образца из белизского Mayahak Cab Pek (ок. 9,3 тыс. л. н.)Cosimo Posth et al. Reconstructing the Deep Population History of Central and South America , 2018 D5a2a1h1 FY-HT-2 (9380±90 л. н.) из китайской пещеры Фуянь (:en:Fuyan Cave)Xue-feng Sun. Ancient DNA and multimethod dating confirm the late arrival of anatomically modern humans in southern China , February 23, 2021 et al. On the misidentification and unreliable context of the new “human teeth” from Fuyan Cave (China) , May 24, 2021Darren Curnoe et al. Reply to Martinón-Torres et al. and Higham and Douka: Refusal to acknowledge dating complexities of Fuyan Cave strengthens our case , June 1, 2021 D4b1c определили у средненеолитического образца N5a из белькачинского могильника Оннёс (Onnyos, 6290—6186 л. н.)Gülşah Merve Kılınç et al. Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia D1 определили у образца ASO_B9_S14a (Arroyo Seco 2, 7832—7573 л. н.) из Аргентины D4 определена у образца DevilsGate1 (5726—5622 лет до н. э.) из пещеры Чёртовы Ворота в ПриморьеVeronika Siska et al. Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago , 2017 D4 определена у представителей культуры Бойсмана (~5000 лет до н. э.) в ПриморьеChuan-Chao Wang et al. The Genomic Formation of Human Populations in East Asia , 2020 D* и D1 выявлены у древних южноамериканцев (D* и D1 в Huaca Pucllana, D1 в Pasamayo, Pueblo Viejo (Перу) и в Llullaillaco (Аргентина)Андрей Коньков. Расшифровка древней ДНК рассказала о происхождении южноамериканских индейцев , 20.04.2016Bastien Llamas et al. Ancient mitochondrial DNA provides high-resolution time scale of the peopling of the Americas, 2016 // Supplementary Materials. Table S2. List of ancient samples, associated metadata, and sequencing results (separate Excel document D4b1a определили у представителей культуры Луншань (2275—1844 лет до н. э.)Chao Ning et al. Ancient genome analyses shed light on kinship organization and mating practice of Late Neolithic society in China, 2021 D4j определили у образца KPT005 (4142—3980 л. н., ранний бронзовый век) из могильника Khaptsagai у деревни Люры (Иркутская область) D2a1a определена у древних алеутов с Алеутских островов (от 2320—1900 до 500—140 л. н.)Pavel Flegontov et al. Paleo-Eskimo genetic legacy across North America , 2017 D2a1 обнаружена у представителя палеоэскимосской культуры Саккак, жившего в Гренландии ок. 4 тыс. лет назадRasmussen, M. et al., «Ancient human gonome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo». Nature 463: 757—762. D4b2b обнаружена у образцов JJD301.1 и JJD301.6 (3300 л. н.) из китайской пещеры Яндзиапо (Yangjiapo Cave) D5a1a2ab определена у образца FY-HT-1 (2510±140 л. н.) из китайской пещеры Фуянь (:en:Fuyan Cave) Митохондриальная гаплогруппа D была обнаружена у мужчины-воина из погребения в Покровске (Якутия), жившего 2400—2200 лет назадAmory S, Crubézy E, Keyser C, Alekseev AN, Ludes B (October 2006). «Early influence of the steppe tribes in the peopling of Siberia». Human Biology 78 (5): 531-49. У представителей среднего периода Яёй определили субклады D4b2b1 (образцы из Doigahama DH-S01 (2,306—2,238 тыс. л. н.) и DH-A) и D4b2a1 (образец HN-SJ002, Hanaura, Япония)Fuzuki Mizuno et al. Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences // Scientific Reports, 2021. У мужчины и женщины хунну из Duurlig Nars в Северо-Восточной Монголии, живших 2000 л. н., определили субклад D4 D1g5 определили у образца LCH.E4.4 (Laguna Chica, 1627—1565 л. н.) из АргентиныXavier Roca-Rada et al. Ancient mitochondrial genomes from the Argentinian Pampas inform the earlypeopling of the Southern Cone of South America, 14 May 2021 (Table 1. Calibrated dates and mitochondrial haplogroups of the 18 Early to Late Holocene individuals from the Argentinian Pampas) Урджарская принцесса из погребения сакского времени (III—IV век до н. э.) в Урджарском районе Восточно-Казахстанской области имела субклад D4oКазахстанский ДНК-проект Исследование ДНК скелета гуннского периода из Музея естественной истории (г. Будапешт), датированного средней третью V века, показало, что он имел субклад D4j12 D2a1 определили у образцов токаревской культуры (вторая половина 1 тыс. до н. э. — начало 1 тыс. н. э.) со стоянки Ольская на мысе Восточный (Ольский) (Магаданская область) D5c1a определили у образца имперского периода Кофун JpIw31 (1303—1377 л. н.)Niall P. Cooke et al. Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations // Science Advances • 17 Sep 2021 • Vol 7, Issue 38. D4o2a определили у образца Yana _young (766 л. н.) с Янской стоянки (Якутия)Martin Sikora et al. The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene , 05 June 2019 (bioRxiv, 2018 ) D4j3a определили у образца AIG002.A0101 (савромато-сарматский период, Aigyrly, Мангистауская область, V—IV вв. до н. э.). Y-ДНК: R1 (R-P238, R-M173)Guido Alberto Gnecchi-Ruscone et al. Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians , 26 Mar 2021. D4b1 определили у мужчины из погребения 688 гунно-сарматского времени памятника Сопка-2 в Барабинской лесостепиПилипенко А. С. Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа // Археология, этнография и антропология Евразии. Том 46 № 4 2018 D4j определена у образца Uyelgi21 из могильника IX века на озере Уелги (Челябинская область)Veronika Csaky et al. Early Medieval Genetic Data from Ural Region Evaluated in the Light of Archaeological Evidence of Ancient Hungarians, 2020 D4m2a выявлена у представительницы охотской культуры NAT004 (1500 л. н.) с острова Ребун (Япония)Genome analysis of an early Okhotsk individual from Hamanaka 2 site, Rebun Island, northern Japan, 18-Jul-2025Genome of an early Okhotsk individual reveals ancient admixture between Jomon and Kamchatka lineages, 27 October 2025 D4o2a, D5b1 определили образцов с кладбища Чжэньзишань (Zhenzishan) в китайском Шанду (XIII век)Jiawei Li et al. Ancient genomes reveal complex genetic history of an international metropolis at Kublai Khan's Upper Capital (Xanadu) , 14 June 2022 D4b1a2a1a обнаружена у образцов с кладбища в Нувуке (Барроу) на Аляске с калиброванными датами между 981 и 1885 годами нашей эрыJustin Tackney et al. Molecular analysis of an ancient Thule population at Nuvuk, Point Barrow, Alaska, 09 January 2019 D1 определена у образца I1742 (880 л. н.) из перуанского Tranca (Laramate, Highlands) D1a2 определили у бразильского образца Brazil-12 (от 888 ± 25 до 4851 ± 30 л. н.) из штата ПернамбукуAndre Luiz Campelo dos Santos et al. Genomic evidence for ancient human migration routes along South America's Atlantic coast, 02 November 2022