Трепанация () — хирургическая операция пробуравливания кости, имеющая целью проникнуть к болезненному очагу (Ушаков).
Выделяют несколько её видов: Трепанация черепа () — хирургическая операция образования отверстия в костях черепа с целью доступа к подлежащей полости. Трепанация сосцевидного отростка височной кости () при мастоидите. Трепанация трубчатых костей при остеомиелите. Трепанация зуба () — вскрытие его полости. Трепано-биопсия — взятие костного мозга для исследования.