Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.
Описание Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences , NC-IUB, 1984.
A = адениндля удобства используются названия оснований, а не нуклеозидов C = цитозин G = гуанин T = тимин R = G A гуанин или аденин — пуриновые (purine) основания Y = T C пиримидиновые (pyrimidine) основания K = G T содержащие кето-группу M = A C содержащие аминогруппу S = G C «сильные» (strong), образующие 3 водородные связи W = A T «слабые» (weak), образующие 2 водородные связи B = G T C (любой, кроме A) D = G A T (любой, кроме C) H = A C T (любой, кроме G) V = G C A (любой, кроме T) N = A G C T (любой)
Символы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна или известны разные её варианты.
Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U (уридин).
Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.
См. также Однонуклеотидный полиморфизм Консервативные мотивы Первичная структура
Примечания
Литература
Ссылки