Фауна Пуэрто-Рико — разнообразие видов животных государства Пуэрто-Рико. Похожа на другие фауны архипелагов и островов Карибского бассейна: большое количество эндемиков, и малое, достаточно специализированное биоразнообразие.

Из всех ныне существующих наземных млекопитающих местными являются только летучие мыши. Все остальные виды наземных млекопитающих были ввезены людьми (домашние кошки, козы, овцы, яванский мангуст (), и обезьяны). Морские млекопитающие Пуэрто-Рико включают дельфинов, ламантинов и китов.

На архипелаге встречаются представители 349 видов птиц, из которых гнездятся здесь 149 видов. Около 47,5 % видов птиц являются редкими.

Наиболее известным и узнаваемым видом фауны Пуэрто-Рико является лягушка-коки () — небольшая древесная лягушка, эндемичная для территории архипелага. Помимо неё, на островах Пуэрто-Рико встречаются ещё 86 видов земноводных и пресмыкающихся.

Некоторые виды пресноводных рыб Пуэрто-Рико являются местными, но имеются также устойчивые популяции видов, интродуцированных человеком.

Для беспозвоночных архипелага характерен тот же принцип, что и для остальных видов (малое богатство, но широкое разнообразие). Именно они представляют большую часть фауны Пуэрто-Рико.

Значительное воздействие на пуэрто-риканский животный мир оказало появление первых людей около 4000 лет назад, и, в большей степени, прибытие европейцев (более 500 лет назад). Охота, разрушение среды обитания местных видов и введение новых, чуждых видов животных привели к тому, что многие местные виды вымерли. Меры по защите и восстановлению местных видов были предприняты только во второй половине XX века. Наиболее заметными являются усилия по спасению попугаев вида Пуэрто-риканский амазон ().

На 2002 год (по данным Международного союза охраны природы) в Пуэрто-Рико под угрозой исчезновения находился 21 вид животных: 2 вида млекопитающих, 8 — птиц, 8 — пресмыкающихся и 3 вида земноводных.

Заселение Пуэрто-Рико

Карибская плита (тектоническая плита, на которой расположены Пуэрто-Рико и Антильские острова) сформировалась в позднем мезозое. Согласно Д. Э. Розену, вулканический архипелаг, известный как «Прото-Антильские острова» образовался при отделении Южной Америки от Африки. Позднее прото-архипелаг разделился на Большие и Малые Антильские острова. Геологически Пуэрто-Рико относительно молод, его возраст составляет около 135 миллионов лет. Согласно гипотезе Говарда Мейерхофа, Пуэрто-риканская гряда (включающая архипелаг Пуэрто-Рико и Виргинские острова, за исключением острова Санта-Крус) имеет вулканическое происхождение, и была сформирована в меловой период. Образцы пород, взятые в горах , расположенных на юго-западе Пуэрто-Рико, датируются поздним юрским/ранним меловым периодами, что подтверждает данную теорию.

Обсуждение научным сообществом способов и времени заселения Антильских островов предками современных позвоночных всё ещё продолжается. Не ясно, был ли Прото-Антильский архипелаг обособлен, или служил в своё время «мостом» между Северной и Южной Америкой. Согласно преобладающей теории, острова были заселены путём «биологического рассевания» () материковой фауной, в основном, южноамериканского происхождения, пересекавшей водные пространства. Другие модели рассматривают замещение прибывающими новыми видами существовавшей прото-антильской фауны. С. Блэйр Хеджес и др. предполагают, что рассеивание было «основным механизмом возникновения Вест-Индийской биоты». Наземные позвоночные, такие как Листовые лягушки (), распространились по территории островов задолго до того, как началось вытеснение местных видов. Тем не менее, вероятно, что другие виды (например, эндемичные насекомоядные Антильских островов — , и другие) колонизировали Вест-Индию гораздо раньше и другими способами. Вудс (1989) также подтверждает эту гипотезу, анализируя прибытие на Антильские острова предков современных хутиевых и колючешиншилловых, и делая вывод, что древние колючешиншилловые могли были прибыть на Большие Антильские острова из Южной Америки либо через Малые Антилы (перемещаясь с острова на остров), либо — через Пуэрто-Рико и Гаити, до которых они добирались вплавьWoods, C. A. (1989). «A new capromyid rodent from Haiti: the origin, evolution, and extinction of West Indian rodents, and their bearing on the origin of New World hystricognaths». In C. C. Black and M. R. Dawson (eds.), Papers on fossil rodents in honor of Albert Elmer Wood. Nat Hist. Mus. Los Angeles County Sci. Ser. 33:59-90..

МакФи и Итурральде-Винент () выдвинули альтернативную гипотезу о том, что инициаторы кладов наземных млекопитающих появились на Прото-Антильских островах в середине третичного периода, ориентировочно — в эоцене или олигоцене. Предполагается, что животные попали на острова по существовавшему в течение 1 миллиона лет перешейку, соединявшему Кубу, Гаити и Пуэрто-Рико с северо-западной частью Южной АмерикиIturralde-Vinent, M. A. & MacPhee, R. D. E. (1999). «Paleogeography of the Caribbean region: implications for Cenozoic biogeography». Bull. Amer. Mus. Nat. Hist. 238:195.. Позже, после распада Прото-Антильских островов, начался процесс дивергенции видов.

Последнее крупное изменение фауны Пуэрто-Рико произошло около 10000 лет назад, после окончания ледникового периода, в связи с таянием ледников, повышением уровня моря и других изменений окружающей среды. Переход от сухой саванны к влажным тропическим лесам привёл к массовому вымиранию, особенно сильно затронувшему позвоночных. Примерно в то же время единый массив суши, куда входили острова архипелага Пуэрто-Рико (кроме островов Мона, Монито и Десечео) и Виргинские острова (за исключением острова Санта-Крус), разделился. Массив суши, известный как «Пуэрто-риканская гряда», по видимому, никогда не соединялся с островом Синт-Мартен.

Млекопитающие

Разнообразие видов млекопитающих в Пуэрто-Рико, как и на многих островах, гораздо меньше, чем на материке. Всего насчитывается 13 «местных» наземных видов млекопитающих, и все они принадлежат к отряду Рукокрылые. Известно 18 видов водных млекопитающих, в число которых входят дельфины, ламантины и киты.

Изучение фоссилий показывает существование в прошлом: одного вида землеройкообразных Nesophontes edithae, одного вида ленивцевНекоторые источники рассматривают существование двух видов ленивцев на территории Пуэрто-Рико, большого пуэрто-риканского ленивца (Acratocnus major) и малого пуэрто-риканского ленивца(Acratocnus odontrigonus)., трёх видов листоносых летучих мышей (Macrotus waterhousii, Monophyllus plethodon, и Phyllonycteris major)Morgan, G. (2001). Patterns of Extinction of West Indian Bats. Pages 369—408 in Biogeography of the West Indies: Patterns and Perspectives. Boca Raton, Florida., и пяти видов грызунов — гигантская хутия Elasmodontomys obliquus, хутия Isolobodon portoricensis и трёх видов колючих шиншилл: Heteropsomys antillensis, Heteropsomys insulans, и Puertoricomys corozalusWoods, C. A., R. Borroto Paéz, and C. W. Kilpatrick. (2001). Insular Patterns and Radiations of West Indian Rodents. Pages 335—353 in Biogeography of the West Indies: Patterns and Perspectives. Boca Raton, Florida.. Вудс определяет причину их исчезновения так:

Виды, развивавшиеся в изоляции на океанических островах, без конкуренции или хищников, могут быть неспособны адаптироваться к быстрому изменению условий [окружающей среды], таких как климатические флюктуации ледниковых периодов, и интродукция конкурентных видов или хищников.

Прочие наземные млекопитающие были интродуцированы человеком. Вместе с коренным населением были завезены собаки и морские свинки из Центральной и Южной Америки. Позднее аравакскими племенами на Гаити были интродуцированы хутии (в качестве источника пищи). При колонизации островов испанцами в XVI веке были завезены разнообразные домашние животные: собаки, кошки, козы, свиньи, крупный рогатый скот, лошади и ослы. Такие виды, как чёрная крыса (Rattus rattus), серая крыса (Rattus norvegicus) и домовая мышь (Mus sp.), вероятно, попали на территорию Пуэрто-Рико с кораблей, начиная с 1493 года.

Совсем недавно ряд видов был введён для биологической борьбы с вредителями. Например, яванский мангуст (Urva javanica) завезён в XIX веке для того, чтобы контролировать чрезмерно разросшуюся популяцию крыс на плантациях сахарного тростника. Данную попытку интродукции можно считать неудачной: мангусты оказались неспособны снизить поголовье крыс, вместо того значительно снизив численность местных видов птиц — малого лесного певуна и жёлтоплечего чёрного трупиала.

В 1938 году Университет Пуэрто-Рико с исследовательскими целями создал колонию макак-резусов на острове Кайо Сантьяго (:en:Cayo Santiago). В рамках исследования приспособляемости на остров Десечео и другие прибрежные острова и рифы в 1967 году были завезены 57 макак-резусов (). До того на острове гнездилась большая колония бурых олуш, но после появления обезьян, поедавших яйца олуш, гнёзд птиц на острове более не осталось. Усилия по поимке и вывозу особей Macaca mulatta успехом не увенчались, и в настоящее время макаки-резусы распространились по юго-западу Пуэрто-Рико. Помимо того, на Пуэрто-Рико представлен и такой вид обезьян, как саймири, или беличьи обезьяны (). В результате вандализма 107 особей саймири сбежали с научно-исследовательской станции в Сабана Сека (муниципалитет ) в 1970-х годах. По последним оценкам, численность популяции саймири составила 35 особей.

Американский ламантин (), вероятно, является одним из наиболее известных видов водных млекопитающих Пуэрто-Рико. Согласно классификации МСОП, он относится к уязвимым видам. Воды архипелага являются одним из основных мест размножения этих ламантинов. Ламантины привлекли сильное внимание местных средств массовой информации, когда сотрудниками компании «Caribbean Stranding Network» (CSN) был спасён двухмесячный детёныш. Его назвали Моисеем () и сотрудники компании заботились о нём на протяжении более чем двух лет. Этот ламантин стал первым в Карибском море животным этого вида, которое смогло приспособиться к жизни в естественных условиях после выращивания людьми. Животное тесно вошло в культуру и науку Пуэрто-Рико после того, как певец написал песню «Moisés». Предположительно, один из муниципалитетов, назван в честь этого вида животных.

Помимо того, пуэрто-риканские воды являются одним из мест размножения горбатых китов, которые приплывают сюда, когда в Северном полушарии наступает зима.

Рукокрылые В настоящее время рукокрылые Пуэрто-Рико представлены пятью семействами: Noctilionidae, Mormoopidae, Phyllostomidae, Vespertilionidae и Molossidae, из которых встречаются 13 видов. 6 видов летучих мышей являются эндемиками. 7 видов насекомоядны, 4 можно считать плотоядными, один вид питается нектаром, и один — рыбой. Летучие мыши играют важную роль в экологии леса и пещер, а насекомоядные виды помогают в борьбе с комарами. Десять из тринадцати видов живут в пещерах и имеют достаточно низкие темпы воспроизводства. Наибольшее число видов рукокрылых (11 из 13) встречаются в заповеднике . Летучая мышь-эндемик вида Stenoderma rufum играет важную роль в экологии лесов табонуко (Dacryodes excelsa), расположенных в горах Лукилло, так как считается единственным распространителем семян балаты (, ). Также следует отметить значение рукокрылых для экологии пещер: большинство беспозвоночных, обитающих в пещерах, являются либо детритофагами, использующих для питания гуано, производимое летучими мышами, либо хищниками, питающимися детритофагами.

Список рукокрылых, обитающих на архипелаге Пуэрто-Рико: Большой зайцегуб (); Подбородколист Блейнвилля (); Подбородколист Парнелла (); Черноватый подбородколист (); (); Сент-винсентский листонос (); Тёмно-жёлтый цветочный листонос (); Ямайский листонос (); Красный фруктоядный листонос (); Большой бурый кожан (); Красный волосатохвост (); Molossus molossus; Бразильский складчатогуб ();

Птицы