Конформа́ция молекулы (от «форма, построение, расположение») — пространственное расположение атомов в молекуле определённой конфигурации, обусловленное поворотом вокруг одной или нескольких одинарных сигма-связей. В некоторых случаях в конформационные преобразования включают и и другие политопные перегруппировки неорганических и элементоорганических соединений.
Стереоизомеры в конформациях, соответствующих минимумам потенциальной энергии, называют конформерами (поворотными изомерами).
Свободное и ограниченное вращение В стереохимическом контексте свободным вращением вокруг химической связи называют такое вращение, когда вращательный барьер настолько низок, что различные конформации не заметны как различные химические разновидности на временных рамках эксперимента. Запрещение вращения групп вокруг связи из-за присутствия достаточно большого вращательного барьера, чтобы сделать явление, заметное на временных рамках эксперимента, называют ограниченным вращением.
Вращательным барьером называют барьер потенциальной энергии между двумя смежными минимумами молекулярного состояния как функцию от угла вращения. То есть это энергетический барьер вращения вокруг связи С-С — энергия, необходимая для перехода из одной устойчивой (например, заторможённой) конформации в другую.
Конформер Кроме термина конформация (), используется термин конформер () или поворотные изомеры: (в химии) любой ряд стереоизомеров, характеризуемый структурой, которая соответствует различным минимумам потенциальной энергииIUPAC Gold Book (в биологии) особое свернутое состояние или структура белка
Ротамер Частным случаем конформера является ротамер () — один из ряда конформеров, являющийся результатом ограниченного вращения вокруг одной-единственной химической связи.
Виды конформаций
Различают следующие виды конформаций: Заторможенная конформация (или трансоидная конформация) () — заместители одного атома на проекции размещены между заместителями другого атома, деля валентные углы, то есть заместители расположены наиболее далеко друг от друга в пространстве. Такие конформации обладают наименьшей энергией. Заслоненная конформация (или цисоидная конформация) () — конформация, в которой заместители как бы налагаются друг на друга или находятся друг относительно друга в наиболее близком положении. Такие конформации обладают наиболее высокой энергией. Скошенная конформация (или конформация «Гош») () — для структуры, содержащей группы R3C–C(Y)=X (с идентичными или различными группами R) структура, в которой угол вращения таков, что X антиперипланарный одной из групп R и, в проекции Ньюмана, двойная связь, C=X делит пополам один из углов R–C–R. В этой структуре связь C–Y заслоняет одну из связей C–R. В заслоненной конформации X синперипланарный одной из групп R.
Катастрофическая конформация (или конформация «Крэш») () — преобразование (инвертирование) структуры группы атомов при тепловых колебаниях решетки, сопровождаемое разрушением межатомной связи при преодолении потенциального барьера инвертирования в фиксированной температурной точке с затратой постоянной величины энергии ниже энергии атомизации решетки и равной удельной теплоте плавления. Такое преобразование связывается с «фактором плавления» в атомной модели перехода из твёрдого конденсированного состояния кристаллического тела в конденсированное состояние жидкости.
Конформации n-членных циклов
Примером шестичленного цикла является циклогексан, существуют также циклические молекулы с другими количествами атомов в цикле. Молекула циклогексана служит удобной моделью для изучения конформаций шестичленных циклов. Среди нескольких возможных конформаций циклогексана наименьшей энергией будет обладать конформация «кресло». Но различают также и другие: Конформация «кресло» (). Конформация «ванна» (). Конформация «твист» () — любые два соседних атома смещены в разные стороны от плоскости, построенной по трём оставшимся. Конформация «корона» (). Конформация «конверт» () — пять атомов из шести находятся на одной плоскости, а шестой выходит из неё ().
Стабильная конформация Стабильная конформация может быть обусловлена образованием дисульфидных мостиков, за счет взаимодействия различных заряженных группировок, гидрофобных взаимодействий или образования водородных связей.
Когда говорят о стабильности, имеют в виду термодинамическое свойство вещества (в данном случае его конформации), которое количественно измеряется с помощью энергии Гиббса. Тогда конформация вещества A более устойчива чем его изомер B, если для реакции A → B. Так, например, имеем две реакции: P → X + Y сопровождается Q → X + Z сопровождается тогда, если , то P более стабильно относительно продукта Y чем Q относительно Z.
См. также Стереохимия Стереоизомер Изомер Конфигурация Вторичная структура Третичная структура
Примечания
Категория:Стереохимия