Колимовирусы () — семейство ДНК-содержащих вирусов растений с механизмом обратной транскрипции и двуцепочечной ДНК, то есть вирусов, содержащих стадию обратной транскрипции в своём репликативном цикле.
Структура вирионов Вирион является простым, без липидной оболочки. Морфология нуклеокапсида представлена 2 основными формами: палочковидной и икосаэдрической. Форма нуклеокапсида зависит от размера вируса. Вирионы палочковидной формы имеют диаметр приблизительно 35—50 нм и могут быть в длину до 900 нм. Икосаэдрический капсид имеет диаметр 45—50 нм и примерно такую же длину.
Структура генома и репликация Геном данного вируса представляет собой несегментированную линейную или циклическую двуцепочечную ДНК. Размер генома насчитывает приблизительно 6—8 kbs. В зависимости от вируса геном может иметь либо одну открытую рамку считывания (ORF), как например у Petuvirus, или больше восьми как у Soymovirus. Геном данного вирусного семейства кодирует такие белки: обратная транскриптаза, протеаза, структурные белки, а также остальные белки с неизвестными функциями, но так или иначе нужные для репликации вируса.
Репликация происходит как в цитоплазме, так и в ядре клетки-хозяина. Сначала, вирусный геном попадает в цитоплазму. Там он формирует суперскрученную минихромосому. На ней транскибируется мРНК вируса, которая избыточна (потому что в некоторые части генома експресируются дважды). Эта транскибируемая РНК попадает в цитоплазму, где она играет две роли. Она может использоваться либо как шаблон для трансляции вирусных белков, либо подвергаться обратной транскрипции до дцДНК, с помощью вирусной ревертазы. Так как эти вирусы имеют много общего с ретровирусами, их часто объединяют в группу параретровирусов. Однако здесь существует важное различие между ретровирусами и вирусами семейства Caulimoviridae. В отличие от ретровирусов они не интегрируют свой геном в хромосомы, так как их геном не кодирует фермента интегразы
Однако существуют виды семейства колимовирусов, такие как Petunia vein clearing virus, которые изредка (в основном в стрессовых условиях) могут интегрировать свой геном в хозяйственный геномHarper G., Hull R., Lockhart B., and Olszewski N. (2002). Viral sequences integrated into plant genomes. Annual Review of Phytopathology 40: 119-136. . PMID 12147756.. Обычно такие провирусы часто называют эндогенными параретровирусами (EPRVs).
Классификация По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на март 2016 года в семейство включают 8 родов.: Род Badnavirus (40 видов) Типовой вид Commelina yellow mottle virus Род Caulimovirus (11 видов) Типовой вид Cauliflower mosaic virus Род Cavemovirus (2 вида) Типовой вид Cassava vein mosaic virus Род Petuvirus (1 вид) Вид Petunia vein clearing virus Род Rosadnavirus (1 вид) Вид Rose yellow vein virus Род Solendovirus (2 вида) Типовой вид Tobacco vein clearing virus Род Soymovirus (4 вида) Типовой вид Soybean chlorotic mottle virus Род Tungrovirus (1 вид) Вид Rice tungro bacilliform virus
Вид Rose yellow vein virus имеет необычную организацию генома, которое делает его уникальным видомMollov D., Lockhart B., Zlesak D. C., Olszewski N. (2012). Complete nucleotide sequence of rose yellow vein virus, a member of the family Caulimoviridae having a novel genome organization. Arch Virol..
Примечания
Ссылки Notes on family; Caulimoviridae. Livia Stavolone, Antonio Ragozzino, and Thomas Hohn. (2003). Characterization of Cestrum yellow leaf curling virus: a new member of the family Caulimoviridae. Journal of General Virology 84: 3459—3464. 14th Swiss Plant Molecular and Cell Biology Conference, March 2005.
Категория:Ortervirales Категория:Семейства вирусов Категория:ДНК-содержащие вирусы