Različice ali variante SARS-CoV-2 so virusni izolati z drugačnim genomskim zaporedjem v primerjavi z divjim virusom SARS-CoV-2, kot je bil izoliran prvotno. Različice virusa so posledica mutacij v njegovi dednini. Po svetu so tekom pandemije krožile različne različice virusa SARS-CoV-2 in določene med njimi so bile skrb vzbujajoče in so zahtevale takojšen odziv ter ustrezno ukrepanje. Pri nekaterih različicah namreč obstaja sum ali pa je dokazano, da so bolj nalezljive, bolj virulentne ali pa so proti njim cepiva manj učinkovita.

Trenutno (podatek za september 2024) sta po merilih Svetovne zdravstvene organizacije aktualni zaskrbljujoči različici SARS-CoV-2 BA.2.86 in JN.1, različice pod spremljanjem pa JN.1.7, KP.2, KP.3, KP.3.1.1, JN.1.18, LB.1 in XEC.

Poimenovanje različic + SARS-CoV-2 corresponding nomenclaturesThis table is an adaptation and expansion of . Linije po PANGO Komentar k linijam po PANGO Nextstrainovi kladi, 2021 Kladi po GISAID-u Pomembne različice 19B S vsebuje »referenčno zaporedje« WIV04/2019 , , , L V 20A G vključuje različico delta(B.1.617) Redno se posodablja. , , , , GH 20C vključuje različici epsilon (B.1.427/B.1.429/CAL.20C) in eta (B.1.525) Se redno posodablja. 20G prevladujoča različica v ZDA (januar 2021) 20H vključuje različico beta(B.1.351 aka linija 20H/501Y.V2 ali 501.V2) 20B GR vključuje linijo B.1.1.207 20D 20J vključuje različici gama(P.1) in zeta (P.2) 20F 20I vključuje različico alfa(B.1.1.7 aka VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 ali 20I/501Y.V1) B.1.177 20E (EU1) GV izvira iz 20A

Doslej še niso sprejeli enotnih pravil glede poimenovanja različic SARS-CoV-2. Številne organizacije, ustanove in tudi vlade so začele različice poimenovati po državah, v katerih so bile odkrite. 31. maja 2021 je Svetovna zdravstvena organizacija predlagala uporabo grških črk za pomembne virusne različice, kar omogoča enostavno, lahko izgovorljivo in nestigmatizirajoče poimenovanje.Helen Branswell The name game for coronavirus variants just got a little easier 31 May 2021 www.statnews.com, dostop: 28. 6. 2021 Odločitev je bila deloma posledica pritožb nekaterih držav, da je lahko poimenovanje z zemljepisnimi oznakami diskriminatorno do tamkajšnjih prebivalcev. Različice so poimenovali zaporedoma s črkami od alfa do mi, nato pa preskočili ni in ksi ter naslednjo različico poimenovali s črko omikron. S tem so se pojavile špekulacije, da so črko ksi preskočili zaradi podobnosti z imenom kitajskega predsednika Šija Džinpinga (v pinjinu se njegovo ime prečrkuje kot Xi). Svetovna zdravstvena organizacija je pojasnila, da se bi lahko poimenovanje »ni« zlahka narobe razumelo kot »new« (angleškim izrazom za 'nov'), Xi pa je pogost priimek. Če bodo porabljene vse črke, se SZO nagiba k uporabi poimenovanj ozvezdij. thumb|Različice SARS-CoV-2, o katerih so poročale organizacije, kot je CDC, in sicer na osnovi mutacij na mestih L452R in E484K Obstaja več tisoč različic virusa SARS-CoV-2, lahko pa jih razvrstimo v več podskupin, kot so linije in kladi. Najbolj razširjene so naslednje tri predlagane nomenklature znotraj znanstvene iniciative GISAID so do januarja 2021 v svetu prepoznali 8 poglavitnih kladov, poimenovanih S, O, L, V, G, GH, GR in GV, znotraj svetovne podatkovne baze Nextstrain so do junija 2021 prepoznali 13 poglavitnih kladov (19A–B, 20A–20J in 21A), v letu 2020 je Rambaut s sodelavci ustanovil Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN), program za razvrščanje in poimenovanje virusnih linij SARS-CoV-2; Cited in do februarja 2021 so prepoznali 6 poglavitnih virusnih (A, B, B.1, B.1.1, B.1.177, B.1.1.7).

Zaskrbljujoče različice Zaskrbljujoče različice (angl. Variants of concern) so različice virusa SARS-CoV-2 z mutacijami v domeni za receptorsko vezavo (RBD, angl. Receptor Binding Domain), ki občutno povečajo vezavno afiniteto virusa na receptorje ter posledično povečajo prenašanje virusa. Svetovna zdravstvena organizacija je tekom pandemije opredelila kot zaskrbljujoče različice naslednje različice virusa SARS-CoV-2: Se redno posodablja. različica alfa – poimenovana tudi linija B.1.1.7 B.1.1.7 z E484K različica beta – poimenovana tudi linija B.1.351 različica gama – poimenovana tudi linija P.1 različica delta – poimenovana tudi linija B.1.617.2 različica omikron – poimenovana tudi linija B.1.1.529 Trenutno (podatek za september 2024) je po merilih Svetovne zdravstvene organizacije aktualna zaskrbljujoča različica omikron, in sicer podrazličici BA.2.86 in JN.1.

Pozornost vzbujajoče različice Pozornost vzbujajoče različice (angl. Variants of Interest) so virusne različice z genetskimi spremembami, pri katerih je znano ali pa se predvideva, da vplivajo na pomembne virusne značilnosti, kot so prenašanje, hudost bolezni, izmikanje imunskemu sistemu oziroma težavnejše diagnosticiranje ali zdravljenje, ter izkazujejo tudi epidemiološko grožnjo (seznam je iz julija 2021): različica lambda – poimenovana tudi linija C.37, prvič prepoznana avgusta 2020 v Peruju, 14. junija 2021 pa jo je SZO uvrstil med pozornost vzbujajoče različice. Razširila se je v vsaj 30 držav po svetu in zaenkrat (do julija 2021) ni znano, ali je bolj kužna in manj občutljiva na cepiva kot drugi sevi; različica mi – poimenovana tudi linija B.1.621, prvič so jo zaznali v Kolumbiji januarja 2021, SZO pa jo je opredelil kot pozornost vzbujajočo različico 30. avgusta 2021. Do izbruhov je prišlo tudi drugod v Južni Ameriki pa tudi v Evropi.

Različice, ki so jih v preteklosti uvrščali med pozornost vzbujajoče različice: različica eta – poimenovana tudi linija B.1.525, 21D ali 20A/S:484K, ne vsebuje mutacije N501Y kot različice alfa, beta in gama, nosi pa enako mutacijo E484K kot različice gama, zeta in beta. Nosi tudi delecijo ΔH69/ΔV70 kot različica alfa. Do 5. marca 2021 so jo zaznali v 23 državah. O prvih primerih so poročali decembra 2020 v Nigeriji in Veliki Britaniji, v začetku leta 2021 pa se je v Nigeriji zelo razširila; različica jota – odkrili so jo v New Yorku novembra 2020 ter jo poimenovali linija B.1.526; do 11. 4. 2021 so jo zaznali že v vsaj 48 ameriških zveznih državah ter v 18 drugih državah po svetu. Spomladi 2021 jo je začela izpodrivati bolj nalezljiva različica alfa; različica kapa – gre za eno od treh sublinij virusne linije B.1.617, poimenovana tudi B.1.617.1, 21B ali 21A/S:154K; prvič so jo odkrili v Indiji decembra 2020. Konec marca je predstavljala že več kot polovico primerov okužb v Indiji (med analiziranimi vzorci);

Pregled pomembnih različic IdentifikacijaPojavSpremembe glede na predhodno krožeče različiceAktivnost nevtralizirajočih protiteles (oziroma učinkovitost, če so podatki na voljo)Oznaka SZO Linija po PANGORazličica po Public Health England (PHE)Nextstrainov kladPrvi kraj izbruhaDatum prvega vzorcaDatum dodelitve statusa skrb vzbujajoče različicePomembne mutacijePrenosljivostVerjetnost hospitalizacijeSmrtnostPo okužbiPo cepljenjuB.1.1.7VOC‑20DEC‑0120I (V1)Združeno kraljestvo20. sept. 2020 18. dec. 202069–70del, N501Y, P681H rowspan="2" rowspan="2" rowspan="2" B.1.1.7 z E484KVOC‑21FEB‑0226. jan. 20215. feb. 2021E484K, 69–70del, N501Y, P681HB.1.351VOC‑20DEC‑0220H (V2)Južna Afrikamaj 202014. jan. 2021K417N, E484K, N501YP.1VOC‑21JAN‑0220J (V3)Brazilijanov. 202015. jan. 2021K417T, E484K, N501YB.1.617.2VOC‑21APR‑0221AIndijaokt. 20206. maj 2021L452R, T478K, P681RB.1.1.529VOC-21NOV-0121KJužna AfrikaP681H, N440K, N501Y, S477N, many others

Opombe

Sklici