-{DnaG}- je bakterijska primaza koja sintetiše kratke RNK oligonukleotide tokom replikacije DNK. Ti RNK oligonukleotidi služe kao prajmeri za DNK sintezu bakterijskom DNK polimerazom Pol III. Na zaostajućem lancu, primaza formira prajmer svakih nekoliko kilobaza. Ti prajmeri služe kao supstrat za sintezu Okazakijevih fragmenta.
-{DnaG}- se vezuje putem nekovalentne interakcije za bakterijsku replikativnu helikazu -{DnaB}- da bi mogla da funkcioniše kao primaza. Oko tri -{DnaG}- primazna proteina se vezuje za svaku -{DnaB}- helikazu. Primaze iniciraju sintezu na specifičnim nukleotidnim sekvencama jednolančane DNK (-{ssDNA}-). Ta sekvenca je -{GTA}- za -{DnaG}-.
-{DnaG}- primaza je monomerni protein s 581 ostataka. Iz proteolitičkih studija proizilazi da ona ima tri funkcionalna domena. -{N}--terminalni domen vezuje -{Zn}-++ (ostaci 1-110). Jon metala je tetraedralno koordiniran između jednog histidina i tri cisteina. Moguće je da oni učestvuju u prepoznavanju -{ssDNA}-. Centralni domen (ostaci 111-433) ispoljava aktivnost RNK polimeraze. Na njemu se sintetiše RNK prajmer. -{C}--terminalni domen (ostaci 434-581) je odgovoran za nekovalentno vezivanje -{DnaG}- za -{DnaB}- helikazni protein.
Reference
Spoljašnje veze
Категорија:ДНК репликација