thumb|-{EcoRI}- kristalna struktura. Dimer vezan za DNK () -{EcoRI}- je endonukleazni enzim izolovan iz sojeva -{E. coli}-. On je deo restrikciono modifikacionog sistema.
-{EcoRI}- se koristi kao restrikcioni enzim u molekularnoj biologiji. On kreira lepljive krajeve sa prepustima na 5' krajevima. Sekvenca nukleinske kiseline gde enzim preseca je -{GAATTC}-, što je komplementarno sa sekvencom -{CTTAAG}-. Ovi krajevi su rotaciono simetrični.
Struktura Primarna struktura Poput mnogih restrikcionih endonukleaza, -{EcoRI}- sadrži -{PD..D/EXK}- motiv unutar svog aktivnog mesta. On se tipično koristi za izolaciji i restrikciju bakterijske plazmidne DNK. U EcoRI ovaj motiv se sastoji od ostataka -{P90, D91, E111, A112, K113(2)1}-.
Tercijarna i kvaternarna struktura Ovaj enzim je homodimer podjedinica sa 31 -{kD}-, koje sadrže globularne domene sa α/β arhitekturom. Svaka podjedinica sadrži petlju izvan globularnog domena koja se obavija oko DNK pri vezivanju..
-{EcoRI}- je kokristalisan sa sekvencom koju normalno preseca. Taj kristal je korišten za rešavanje strukture kompleksa . Rešena kristalna struktura pokazuje da su podjedinice enzima homodimeri koji simetrično interaguju sa DNK. U kompleksu, dva α-heliksa sa svake podjedinice zajedno formiraju heliksni svežanj. Na interagujućim heliksima su ostaci -{Glu144}- i -{Arg145}-, koji formiraju prsten putem kojeg dva aktivna mesta enzima komuniciraju.
Reference
Literatura
Vidi još -{EcoRII}-, nukleazni enzim iz -{E. coli}-. -{EcoRV}-, nukleazni enzim iz -{E. coli}-.
Spoljašnje veze
Категорија:ЕЦ 3.1.21 Категорија:Рестрикциони ензими Категорија:Молекуларна биологија Категорија:Бактеријски ензими