Kalpain (, ) je protein koji pripada familiji kalcijum-zavisnih, nelizozomalnih cisteinskih proteaza (proteolitičkih enzima) svestrano izraženih kod sisara i mnogih drugih organizama. Kalpaini sačinjavaju C2 familiju proteaznog klana CA u MEROPS bazi podataka. Kalpainski proteolitički sistem obuhvata kalpain proteaze, malu regulatornu podjedinicu CAPNS1, poznatu kao CAPN4, i endogeni, za kalpain specifični inhibitor, kalpastatin.
Specifičnost presecanja Kalpain ne prepoznaje jedinstvenu aminokiselinsku sekivencu. Na proteinskim supstratima, elementi tercijarne strukture umesto primarnih aminokiselinskih sekvenci su verovatno odgovorni za usmeravanje presecanja na datom supstratu. Među suptratima koji su peptidi i mali molekuli, najkonzistentnija specifičnosti je za male, hidrofobne aminokiseline (npr. leucin, valin i izoleucin) u P2 poziciji, i velike hidrofobne aminokiseline (npr. fenilalanin i tirozin) u P1 poziciji. Verovatno trenutno najdostupniji fluorogeni supstrat kalpaina je (EDANS)-Glu-Pro-Leu-Phe=Ala-Glu-Arg-Lys-(DABCYL), koji biva presecan na Phe=Ala vezi.
Šira familija
Projekat ljudskog genoma je pokazao da postoji više deset kalpainskih izoformi, neke od koji imaju višestruke splajsne varijante. Kao prvi kalpain čija trodimenzionalna struktura je određena, m-kalpain je prototipna proteaza C2 (kalpainske) familije u MEROPS bazi podataka.
Gen Protein Alijasi Tkivno izražavanje Veza s bolestima CAPN1 Kalpain 1 Kalpain-1 velika podjedinica, Kalpain mi-tip sveprisutan CAPN2 Kalpain 2 Kalpain-2 velika podjedinica sveprisutan CAPN3 Kalpain 3 specifičan za skeletalni mišić retine i sočiva Limb Girdlova maskularna distrofija 2A CAPN5 Kalpain 5 sveprisutan (visoka zastupljenost u debelom i tankim crevima i testisima) moguća veza sa nekrozom,pošto je ortologan sa C. elegans nekroznim genom tra-3 CAPN6 Kalpain 6 CAPNX, Kalpamodulin CAPN7 Kalpain 7 palBH sveprisutan CAPN8 Kalpain 8 isključivo u sluzokoži želuca i GI traktu moguće je da je povezan sa formiranjem polipa debelog creva CAPN9 Kalpain 9 isključivo u sluzokoži želuca i GI traktu moguće je da je povezan sa formiranjem polipa debelog creva CAPN10 Kalpain 10 gen podložnosti za tip II dijabetes CAPN11 Kalpain 11 testis CAPN12 Kalpain 12 sveprisutan, ali visoko izražen u folikulama kose CAPN13 Kalpain 13 testis i pluća CAPN14 Kalpain 14 sveprisutan CAPN17 Kalpain 17 samo ribe i vodozemci SOLH Kalpain 15 Sol H (homolog drozofilinog gena sol) CAPNS1 Kalpain mala podjedinica 1 Kalpain 4 CAPNS2 Kalpain mala podjedinica 2
Reference
Literatura
Spoljašnje veze
CaMPDB, Calpain for Modulatory Proteolysis Database The Calpain Family of Proteases. (2001). University of Arizona. Calpain Info with links in the Cell Migration Gateway Alzheimers and calpain protease, PMAP The Proteolysis Map-animation.
Категорија:ЕЦ 3.4.22 Категорија:Пептидазе Категорија:Протеинске фамилије