Agathomyia perplexa är en tvåvingeart som beskrevs av Johnson 1916. Agathomyia perplexa ingår i släktet Agathomyia och familjen svampflugor.
Artens utbredningsområde är New York. Inga underarter finns listade i Catalogue of Life.
Källor Systema Dipterorum. Pape T. & Thompson F.C. (eds), 2011-01-06
Kategori:Svampflugor perplexa