Ekholmen kan syfta på:
Sverige
Ekholmen (naturreservat) – ett naturreservat i Hallstahammars kommun i Västmanlands län, Ekholmens slott – Veckholms socken, Enköpings kommun, Ekholmen, Österåkers kommun – ö med fritidsfastigheter, Ekholmens naturreservat, Botkyrka kommun – Ekholmen, Värmdö kommun – ö intill Nämdö i Värmdö kommun, Ekholmen, Nynäshamns kommun - udde i Ösmo socken, Nynäshamns kommun, Ekholmens naturreservat, Uddevalla kommun – Ekholmens herrgård – Gunnarsnäs socken, Melleruds kommun, Ekholmens slottsruin – medeltida borg i Trollhättans kommun, Ekholmen, Linköping – stadsdel i Linköping, Ekholmen, Karlskrona – en holme i Karlskrona,
Finland
Ekholmen, Pargas, ö i Pargas stad, (11 ha) Dyvelholmen och Ekholmen, ö i Kimitoön, (30 ha) Ekholmen, Hangö, ö i Hangö, Ekholmen, Raseborg, Nyland,
Se även Ekholm – flera betydelser Lilla Ekholmen – flera betydelser Stora Ekholmen Ekholmarna Ekholma – en småort i Herrestads socken, Uddevalla kommun, Ekholmsnäs – naturområde på Lidingö,