São Tomé kan syfta på följande platser:
Brasilien
Sumé (ort), Paraíba, São Tomé (ort), Rio Grande do Norte, São Tomé (kommun i Brasilien, Rio Grande do Norte, lat -5,97, long -36,11), São Tomé (kommun i Brasilien, Paraná), Indien São Tomé – namn under portugisiskt styre, se Chennai São Tomé och Príncipe
São Tomé, stad, São Tomé (ö), ö, São Tomés flygplats – internationell flygplats på ön São Tomé São Tomé och Príncipe (koloni) – portugisisk kolonin –1975