Relationer mellan Egypten och Estland började på diplomatisk nivå i sin nuvarande form 2 januari 1992, efter att Egypten erkänt Estland 6 september 1991. Båda länderna hade dock erkänt varann redan under Estlands första självständighetstid. Estlands ambassad i Kairo öppnades i mars 2010. Det är Estlands enda ambassad i Afrika och Arabländerna.
I början av 1920-talet bodde det tiotals ester i Egypten, de flesta lämnade dock Egypten senare.
Besök Tidpunkt Beskrivning januari 2005 Kristiina Ojuland besökte Kairo och Alexandria. I Kairo träffade hon Amr Musa, Ahmed Aboul Gheit, Faiza Abou el-Naga och Mustafa Alfeq. november 2005 Andrus Ansip träffade Ahmad Nazif i Barcelona. december 2007 Andrus Ansip mötte Ahmad Nazif i Lissabon. mars 2009 Urmas Paet och Ahmed Aboul Gheit träffades i Kairo. mars 2010 Urmas Paeti besökte Egypten och öppnade Estlands ambassad i Kairo.
Källor Om relationerna mellan Egypten och Estland på Estlands ambassad i Kairos nätsidor