Sankt Nicolai församling eller Sankt Nikolai församling kan syfta på:
Sankt Nicolai församling Sankt Nicolai församling, 1260–1907, namnändrat till Storkyrkoförsamlingen år 1907 och till Stockholms domkyrkoförsamling 1989 Sankt Nicolai församling, Nyköping – en tidigare församling i Strängnäs stift i Nyköpings kommun –1953 Nyköpings Sankt Nicolai församling – en tidigare församling i Nyköpings kontrakt i Strängnäs stift 1953–2014 Sankt Nicolai församling – innan 1550 namnet på Arboga landsförsamling
Sankt Nikolai församling Sankt Nikolai församling, Halmstad – en tidigare församling i Halmstads och Laholms kontrakt i Göteborgs stift –2016 Sankt Nikolai församling, Skara stift – en tidigare församling inforlivad i Skara stadsförsamling på 1500-talet Sankt Nikolai katolska församling – en församling inom Romersk-katolska kyrkan i Stockholms katolska stift 1961–
Nikolai församling Nicolai församling- en tidigare församling i Göteborg