Чемпіонат України з футболу серед аматорів 1998—1999 вдруге проводився під егідою ААФУ, тривав з 22 серпня 1998 по 6 червня 1999 року. У ньому взяли участь 35 команд, які на першому етапі були розділені на 4 групи. Перші дві команди з кожної групи здобули право виступу у фінальному турнірі.

Груповий турнір Група 1 Підсумкове становище команд #Команда123456789ІВНПМ О1«Троянда-Експрес» (Гірка Полонка)1:01:1+:-1:04:11:03:05:016104223−11342«Динамо» (Львів)1:13:15:15:02:02:05:11:11695231−11323«Явір» (Цумань)0:00:0+:-2:03:04:03:08:01695234−16324«Нива-Текстильник» (Дунаївці)0:12:02:21:33:02:04:02:01681724−19255«Кіровець» (Могилів-Подільський)0:00:05:20:1+:-2:15:10:11673621−18246«Бескид» (Надвірна)1:22:2-:+6:12:12:1-:++:-1652916−20177«Опілля» (Рогатин)2:10:11:2-:-0:0+:-1:11:01652914−20178«Металіст» (Здолбунів)4:01:42:42:41:41:21:53:116411118−45139«Дністер» (Новодністровськ)1:2-:+2:20:10:10:01:2-:+1613127−286 Команда «Бескид» знята з розіграшу.

Найкращі бомбардири: («Троянда-Експрес»), («Динамо» Львів) — по 7.

Група 2 Підсумкове становище команд #Команда12345678ІВНПМ О1ГПЗ (Варва)4:10:02:12:13:05:03:014122036−7382КХП (Черняхів)0:11:05:20:03:12:01:01481519−16253«Рефрижератор» (Фастів)0:13:03:20:1+:-2:16:21472520−16234«Оболонь-Зміна-2» (Київ)0:01:0-:+1:0+:-2:01:01471620−16225УФЕІ (Ірпінь)1:41:00:01:0+:-3:11:01464412−12226«Домобудівник» (Чернігів)2:3-:+3:14:33:2-:+-:+1450916−15157«Хімік» (Рівне)1:41:24:11:60:00:31:014311010−31108«Інтеркас» (Київ)0:42:41:40:11:1-:+1:01421117−277 -ФК «Славутич»—————————————— ФК «Славутич» знявся із змагань.

Найкращий бомбардир: (ГПЗ Варва) — 9.

Група 3 Підсумкове становище команд #Команда12345678910ІВНПМ О1«Кристал» (Пархомівка)1:22:0+:-+:-1:01:02:03:0+:-18151219-6462«Арсенал» (Харків)1:13:22:0+:-+:-+:-0:0+:-2:018144016-5463«Енергетик» (Комсомольське)1:20:00:23:10:05:13:05:0+:-18113419-12364«Металург» (Комсомольське)2:00:01:1+:-+:-2:23:32:0+:-1894516-14315«Золоте-Алмаз» (Первомайськ)0:50:1-:+0:1-:-+:-1:0-:-1:11842126-14146«Слов'янець» (Конотоп) -:+1:2-:+2:12:1-:-1:0-:-3:11840149-9127«Харчовик» (Попівка) -:+0:1-:+-:+0:01:0-:-3:0-:-18331210-10128«Шахта Україна» (Українськ) -:+0:1-:+2:1-:--:-1:11:02:21825119-12119«Південьсталь» (Єнакієве) -:+0:1-:+-:+1:21:0-:--:-1:01820163-17610«Сула» (Лубни)0:1-:+0:12:1-:+-:-0:2-:--:-1812156-145 Команди «Золоте-Алмаз», «Харчовик», «Слов'янець», «Шахта Україна», «Південьсталь» і «Сула» знято з розіграшу.

Найкращий бомбардир: («Енергетик» Комсомольське) — 9.

Група 4 Підсумкове становище команд #Команда1234567ІВНПМ О1«Дністер» (Овідіополь)1:04:13:08:0+:-4:01292126-4292СВХ «Даніка» (Сімферополь)1:05:11:08:0+:-2:01290319-5273«Гірник» (Балаклава)1:1-:+2:03:00:0+:-1253411-10184СК «Первомайськ»0:01:00:03:01:1+:-125348-10185«Геркулес» (Новоукраїнка)0:30:1+:-2:1+:-2:1125074-31156«Локомотив» (Знам'янка)1:22:1-:+-:+3:0+:-123368-5127«Ікар-МАКБО-94» (Кіровоград) -:+-:+0:31:2-:+1:11201113-141 Команди «Локомотив» і «Ікар-МАКБО-94» знято з розіграшу.

Найкращі бомбардири: («Дністер») — 5.

Фінальний турнір Луцьк (2-6 червня 1999 року) Група А #Команда1234ІВНПМО1«Кристал» (Пархомівка)2:2 31205−452«Троянда-Експрес» (Гірка Полонка) 1:00:031203−253«Дністер» (Овідіополь)2:2 31114−334КХП (Черняхів)0:1 0:230120−31

Група Б #Команда1234ІВНПМО1«Динамо» (Львів)2:1 0:032106−272ГПЗ (Варва) 1:0 32014−263СВХ «Даніка» (Сімферополь)1:4 31024−534«Арсенал» (Харків) 0:20:330120−51

Стикові ігри Матч за 7-8 місця: «Арсенал» (Харків) — КХП (Черняхів) — 3:0 Матч за 5-6 місця: «Дністер» (Овідіополь) — СВХ «Даніка» (Сімферополь) — 3:0 Матч за 3-4 місця: ГПЗ (Варва) — «Троянда-Експрес» (Гірка Полонка) — 6:3 Матч за 1-2 місця: «Динамо» (Львів) — «Кристал» (Пархомівка) — 1:0

Підсумкове становище «Динамо» (Львів) «Кристал» (Пархомівка) ГПЗ (Варва) «Троянда-Експрес» (Гірка Полонка) «Дністер» (Овідіополь) СВХ «Даніка» (Сімферополь) «Арсенал» (Харків) КХП (Черняхів)

Підсумки Здобули путівки в другу лігу чемпіон України серед аматорів «Динамо» (Львів) та учасник фінального турніру чемпіонату України серед аматорів «Арсенал» (Харків), а також «Оболонь-Зміна-2» (Київ), «Прикарпаття-2» (Івано-Франківськ), «Нива» (Вінниця), «АДОМС» (Кременчук), «Машинобудівник» (Дружківка).

Див. також Чемпіонат України з футболу 1998—1999 Кубок України з футболу 1998—1999 Кубок України з футболу серед аматорів 1998—1999

Джерела Чемпіонат України серед КФК 1998/99 — Офіційний сайт ФФУ Чемпионат Украины среди аматоров 1998/99 — Украинский футбол от Алексея Кобызева