Інститут рукопису Національної бібліотеки України імені В. І. Вернадського — науково-дослідницький інститут, що займається вивченням, публікацією та збереженням рукописних фондів бібліотеки імені Вернадського. Створений 1992 року на базі відділу рукописів Національної бібліотеки України.
Структура Інституту рукопису складається з чотирьох відділів: відділ кодикології та кодикографії, відділ джерелознавства, відділ фондів рукописної спадщини та відділу фондів юдаїки.
Відділ кодикології та кодикографії займається науковим описом та каталогізацією рукописної книги, що зберігається в фондах Інституту рукопису, організує підготовку каталогів та документальних публікацій пам'яток писемності. Відділ джерелознавства проводить науково-технічне опрацювання архівних фондів, інвентаризацію фондів, підготовку довідників. Відділ фондів рукописної спадщини займається організацією роботи зі збереження фондів, обслуговування читачів, створення науково-довідкового апарату та обліку архівного фонду. Відділ фонду юдаїки забезпечує зберігання, опрацювання та використання колекції єврейських рукописів та книг.
Читальна зала Інституту рукопису розташована у будівлі по вул. Володимирській, 62.
Директор Інституту рукопису — кандидат історичних наук Ольга Петрівна Степченко.
Напрями діяльності Збирання й формування повноцінного рукописного фонду, що відображає історію, науку та культуру України від давніх часів до сьогодення, а також організація й підтримання максимально сприятливих умов для зберігання рукописів. Залучення рукописів та історичних документів до наукового і суспільного обігу. Популяризація рукописної та документальної спадщини України. Розвиток допоміжних споріднених історичних та філологічних дисциплін, об'єктом вивчення яких є рукопис (кодикологія та кодикографія, польова та камеральна археографія, джерелознавство, дипломатика, архівознавство, документознавство тощо. Видавнича діяльність.
Фонди інституту рукопису Фонди інституту становлять понад 560 тисяч одиниць зберігання, з яких понад 8 тисяч рукописних книг. Основою фонду стали націоналізовані у період української революції 1917–1920 років бібліотечно-рукописні колекції, матеріали окремих осіб, передані в дар Національній бібліотеці та архівні матеріали особових архівів.
Найдавніші зібрання рукописних документів походять з фондів Київської духовної академії з її археологічним музеєм та матеріалами її попередників — Києво-Могилянської академії, братських шкіл, Ніжинського історико-філологічного інституту ім. кн. Безбородька, Київського університету св. Володимира (разом зі збірками Кременецького ліцею та інших навчальних закладів). Частина документів потрапила до інституту з фондів Волинського державного музею, Уманського краєзнавчого музею та Кам'янець-Подільського історичного музею.
Чимало документів походять з бібліотек релігійних організацій та монастирів: Софійського монастиря, Михайлівського Золотоверхого монастиря та деяких інших київських монастирів, а також козацького Межигірського монастиря, Києво-Печерської лаври і Почаївської Лаври.
Східні рукописи представлені найстарішими пам'ятками писемності: клинопаисними табличками з Месопотамії (початок III тис. до н. е.); рукописом народу баттів з о. Суматра XVIII століття, виконаним на корі дерева; рукописами на пальмових листях з Індії та о. Цейлон; тибетськими та китайськими рукописами різного часу; абіссінськими (зараз Ефіопія) рукописами XV і подальших століть; перськими та арабськими рукописами (переважно, це списки корану XIII-XIV століть, коментарі, теологічні, юридичні, літературні та філософські твори пізнього середньовіччя). Турецька рукописна книга та документи (грамоти султанів) представлена матеріалами XV-XVIII століть. Особливу цінність складають вірменські кодекси XIII століття та уривки з грузинських кодексів різного часу.
Колекція грецьких рукописів налічує близько 200 книг та документів. Латинських рукописів всього близько 50 (більшість з них в уривках), найціннішими з яких є рукописи польсько-литовського та українського походження. Більшість польських рукописів датується XVI-XVIII століттями. Рукописи східнослов'янськими мовами датовані XV-XVI століття, вони складають близько 400 одиниць збігання.
Український живопис XVIII століття представлений унікальною збіркою малюнків школярів Київської майстерні, що розташовувалася в Києво-Печерській лаврі.
У фондах інституту рукопису зберігаються також численні особисті архіви діячів української культури й науки, перелік яких можна знайти у виданні «Особові архівні фонди Інституту рукопису»Пошук Онлайн та «Архіви, колекції та зібрання державних, громадських та релігійних установ у фондах Інституту рукопису Національної бібліотеки України імені В. І. Вернадського : путівник»Опубліковано новий путівник по документальних фондах Інституту рукопису НБУВ. Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського. .
Скарби інституту рукопису Київські глаголичні листки (X ст.) — одна з найдавніших глаголичних пам'яток старослов'янської писемності. Сліпченський Апостол (XII ст.) — рукопис на пергаменті. Оршанське Євангеліє (XIII ст.) Сербський Апостол (XIV ст.) Києво-Печерський патерик (у списку XV століття); Пересопницьке євангеліє (1556–1561); Український розмовник кінця XVI століття — одна з найдавніших пам'яток української розмовної мови; Супрасльський Ірмологіон Львівський літопис (1498–1649); Густинський літопис; Хроніка з літописців стародавніх Феодосія Сафоновича; Літопис Самовидця; Литовські статути; 12 книжок з філософськими творами Григорія Сковороди Єврейські рукописні книги та колекція пинкасім
Основні публікації інституту Каталог арабских рукописей из ЦНБ имени В. И. Вернадского АН УССР. Каталог / Упор. А. В. Савченко. — К., 1988. Грецькі рукописи з фондів Бібліотеки Академії наук Української РСР у Києві. Каталог виставки / Укл. Л. А. Дубровіна, О. М. Гальченко. — Афіни, 1988. — 23 с. (грецькою мовою) Дубровіна Л. А. История о Казанском царстве (Казанский летописец). Списки и классификация текстов. — К., 1989. З епістолярної спадщини акад. В. І. Вернадського. Листування до акад. М. П. Василенко та О. О. Богомольця / Укл. С. М. Кіржаєв, В. О. Толстов. — Київ, 1991. Документальні матеріали М. С. Грушевського з фондів Центральної наукової бібліотеки ім. В. І. Вернадського Академії наук України / Укл. С. М. Кіржаєв. — Київ, 1991. Грецькі актові документи та листи з фондів Центральної наукової бібліотеки імені В. І. Вернадського Академії наук України. Каталог рукописів XVI-XIX ст. / Укл. Ю. К. Чернухін. — Київ, 1991. Дубровіна Л., Гальченко О. Іванова О. Кодикографія української та східнослов'янської рукописної книги і кодикологічна модель структури формалізованого опису рукопису. — К., 1992. Дубровіна Л. Кодикологія та кодикографія української рукописної книги. — К., 1992. Ділова документація Гетьманщини XVIII ст.: Зб. документів / Упоряд., автор передмови та комент. В. Й. Горобець. — К., 1993. Синові України: Збірник статей 1906 року на пошану проф. Володимира Антоновича (Фототипне відтворення). — К., 1993. Рукописна та книжкова спадщина України: Археографічні дослідження унікальних архівних та бібліотечних фондів: Зб. наук. праць ІР НБУВ. — К., 1993. — Вип. 1. Пантелеймон Куліш. Щоденник / Упор. тексту, прим. С. Кіржаєва. — К., 1993. Історія Академії наук. 1918–1923: Документи і матеріали / Упор.: В. Г. Шмельов (ст. упор.), В. А. Кучмаренко, О. Г. Луговський, С. В. Бакалійко та ін. — К., 1993. Рукописна та кижкова спадщина України: Археографічні дослідження унікальних архівних та бібліотечних фондів: Зб. наук. праць ІР НБУВ. — К., 1994. — Вип. 2. Вісті Таврійської вченої архівної комісії і Таврійського товариства історії, археології та етнографії (1887–1931): Бібліогр. покаж. / Укл. Людмила Шарипова. — Київ, 1994. Олена Михайлівна Апанович: Бібліографічний покажчик (до 75-річчя від дня народження і 50-річчя наукової діяльності / Упор. С. Даневич; авт. вступної статті: Л. Дубровіна, В. Гром. — К., 1994. Національна архівна інформаційна система: структура даних (Матеріали для обговорення) / Укл. Л. А. Дубровіна, за участю О. В. Соханя. — К., 1994. Б. Д. Грінченко. Документи і матеріали фондів Інституту рукописів Центральній наукової бібліотеки: Покажчик / Упор. Н. М. Зубкова. — Вип.1. Поезії. — К., 1994. Киржаев С. Н, Имаи Е. Николай Петрович Баллин и его архив: библиографическое исследоавание о пионере русско-украинского кооперативного движения. // Ацта славіца йапоніца. — Т.12. — 1994. Саппоро, Йапан. — П.161-179. В. Б. Антонович. Курс лекцій з джерелознавства. 1880–1881 (Історія України в університетських лекціях. Вип.1) / Упор., передмова, примітки О. Василюк / НАН України. — К., 1995. Грецький Схід і Україна: Листи грецького духовенства XVIII ст. в фондах Інституту рукопису ЦНБ ім. В. І. Вернадського / Передмова і переклади Є. К. Чернухіна. — К., 1994. Національна архівна інформаційна система «Архівна та рукописна Україніка» і комп'ютеризація архівної справи в Україні // Зб. наук. праць. — К., 1995. — Вип.1: Інформатизація архівної справи в Україні: Сучасний стан та перспективи. Просвітителі Кирило і Мефодій у писемних джерелах Інституту рукопису ЦНБ НАН України: Каталог рукописів другої половини XV-першої чверті ХХ ст. / Укл. Л. А. Гнатенко. — К., 1995. Києво-Могилянська академія у документах і рідкісних виданнях центральної наукової бібліотеки імені В. І. Вернадського НАН України. Видання XVIII — першої чверті ХХ ст. Матеріали до бібліографічного покажчика. Вип. 1. / Укл. Л. М. Дениско, за участю М. С. Рубльової, В. Р. Галай. — К., 1995. Д. П. Деляфліз. Альбоми. — К., 1996. — Т. 1: Серія Етнографічно-фольклорна. В. Л. Модзалевський. Малоросійський родословник. — К., 1996. — Т. V. — Вип. 1. Рукописна та книжкова спадщина України. Археографічні діслідження унікальних архівних та бібліотечних фондів // Зб. наук праць ІР НБУВ. — К., 1996. — Вип. 3. Муха Л. В. Бібліотечні книжкові колекції та зібрання: походження, історія, реконструкція. — К., 1997. Рукописна та книжкова спадщина України: Археографічні дослідження унікальних архівних та бібліотечних фондів // Зб. наук праць ІР НБУВ. — К., 1998. — Вип. 4. Корній Л., Дубровіна Л. Болгарський наспів з рукописних нотолінійних ірмолоїв України кінця XVI- XVII ст. — Київ, 1998. В. Л. Модзалевський. Малоросійський родословник. — К., 1998. — Вип. 2. Дубровіна Л., Онищенко О. Історія Національної бібліотеки України імені В. І. Вернадського: 1918–1941. — К., 1998. Видатні вчені Національної академії наук України: особові архівні і рукописні фонди академіків і членів-кореспондентів у Національній бібліотеці України імені В. І. Вернадського (1918–1998). Путівник. — К., 1998. Д. П. Деляфліз. Альбоми. — К., 1999. — Т. 2: Серія Етнографічно-фольклорна. Музичний архів М. Леонтовича. Автографи М. Леонтовича у фондах Інституту рукопису НБУВ НАН України. Каталог / Упор. Л. П. Корній, Е. С. Юрченко. — К., 1999. Сокровища еврейськой культуры в Украине: Уникальные фонографические записи еврейского фольклора. 1912–1947 гг. / Укл. І. А. Сергеєва, Л. В. Шолохова. — К., 1997. Видання на CD-ROM. Грецькі рукописи у зібраннях Києва / Укл. К. Є. Чернухін. — К., 2000. Особові архівні фонди Інституту рукопису: Путівник // Ред. колегія: О. С. Онищенко (відп. редактор); Г. В. Боряк; С. Г. Даневич (відп. секретар); Л. А. Дубровіна (заст. відпов. редактора); Н. М. Зубкова; Т. І. Ківшар; С. Г. Кулєшов; В. Ю. Омельчук; Ю. А. Пінчук; П. Т. Тронько / Національна академія наук України. Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського. Інститут рукопису. — К., 2002. — 768 с. Дубровіна Л. А. Історія Національної бібліотеки України імені В. І. Вернадського, 1941-1964 / Л. А. Дубровіна, О. С. Онищенко; НАН України, Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського. — К.: Наукова думка, 2003. — 357 с. — (Проект «Наукова книга»).