KDM6B () — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 643 амінокислот, а молекулярна маса — 176 632.
Кодований геном білок за функціями належить до є деметилазою гістонів - оксидоредуктазою та регулятором хроматину. Бере участь у формуванні запальної відповіді. Білок підлягає альтернативному сплайсингу. Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку та іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Ген У промоторі гену наявні декілька сайтів зв'язування NF-κB. На відміну від іншого ферменту KDM6A, який експресується постійно, експресія гену KDM6B індукується низкою факторів, як-то чинниками ембріогенезу, онкогенезу, медіаторами запалення, індукторами мітохондріального стресуCao, Z., Shi, X., Tian, F. et al. KDM6B is an androgen regulated gene and plays oncogenic roles by demethylating H3K27me3 at cyclin D1 promoter in prostate cancer. Cell Death Dis 12, 2 (2021). https://doi.org/10.1038/s41419-020-03354-4.
Білок Білок KDM6B містить домен Jumonji C (JmjC). Відповідає за деметилювання трьох метильних груп 27-го лізину гістону H3 (H3K27me3) — зміну епігенетичної мітки.
Білок бере участь у регуляції диференціації, проліферації, зістарення та апопотозу, зокрема в ході індивідуального розвитку хребетних, онкогенезу, запальних захворювань, нейродегенеративних хвороб.
Фізіологічна роль У мезенхімальних стромальних клітинах кісткового мозку ссавців потрійне деметилювання 27-го лізину гістону H3 веде до диференціації клітин убік остеоцитів, а не адипоцитівMarvin Sylvestre et al. KDM6B drives epigenetic reprogramming associated with lymphoid stromal cell early commitment and immune properties.Sci. Adv.9,eadh2708(2023). DOI:10.1126/sciadv.adh2708.
У червоновухих прісноводних черепах ген KDM6B експресується на вищому рівні при нижчій температурі +26 °C, формуючи зародок самця, і навпаки за підвищеної температури +32 °C ген Kdm6b активний на більш низьких рівнях, при цьому зародок стає самицею. Генетичний нокаут Kdm6b призводить до формування самиць.
Патології Під час інфекції респіраторно-синцитіального вірусу кількість білка KDM6B підвищується та, ймовірно, веде до збільшення синтезу цитокінів CCL2 та CCL5.
Надмірна експресія гену спостерігається при низці онкологічних захворювань крові. Підвищена кількість білка корелює з надмірною активністю NF-κB в CD34-позитивних гемопоетичних стовбурових клітинах за умов мієлодиспластичного синдрому.
У 2022 році було опубліковано дослідження про можливий зв'язок мутацій гена KDM6B з розвитком церебральної фолатної недостатності.
Література
Примітки
Див. також Хромосома 17