Каппа-варіант — це варіант SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Це одна з трьох підліній лінії Панго B.1.617. Каппа-варіант SARS-CoV-2 також відомий як лінія B.1.617.1 і вперше був виявлений в Індії в грудні 2020 року. До кінця березня 2021 року підваріант каппа становив більше половини захворюваностей, які були зафіксовані з Індії. 1 квітня 2021 року Служба охорони здоров’я Англії назвала його варіантом, що під наглядом (VUI-21APR-01).

Мутації

+/br> Ген Нуклеотид Амінокислота ORF1ab C3457T - C4957T T1567I A11201G T3646A G17523T M5753I A20396G K6711R P314L G1129C M1352I K2310R S2312A Спайк T21895C - T21895C E154K T22917G L452R G23012C E484Q D614G C23604G P681R Q1071H Н G28881T R203M D377Y М I82S ORF3a C25469T S26L ORF1a T1567I T3646A ORF7a T27638C V82A Джерело: covariants.org та PHE Technical Briefing 9 Каппа-варіант має три помітні зміни в амінокислотних послідовностях, усі з яких містяться в коді білка спайка вірусу.

Три помітні заміни: L452R, E484Q, P681R.

L452R. Заміна в положенні 452, заміна лейцину на аргінін. Цей обмін забезпечує більш високу спорідненість білка-шипа до рецептора ACE2 разом із зниженням здатності імунної системи розпізнавати. E484Q. Заміна в позиції 484, заміна глутамінової кислоти на глутамін. Ця зміна надає варіанту сильніший потенціал зв’язування з ангіотензин-перетворювальним ферментом 2, а також кращу здатність уникати імунної системи хазяїна. P681R. Заміна в положенні 681, заміна проліну на аргінін.

Європейський центр з профілактики та контролю захворювань (ECDC) також перераховує четверту мутацію, що цікавить:

D614G. Це заміна в позиції 614, заміна аспарагінової кислоти на гліцин. Інші варіанти, які мають мутацію D614G, включають варіанти бета і дельта, і мутація пов’язана з підвищеною інфекційністю.

Дві інші мутації, які можна знайти ближче до обох кінців області спайка, - це T95I і Q1071H.

Історія

Міжнародне виявлення Варіант Каппа вперше був ідентифікований в Індії в грудні 2020 року.

Станом на 11 травня 2021 року щотижневі епідеміологічні оновлення ВООЗ повідомляли про 34 країни з виявленням субваріанта, однак до 25 травня 2021 року кількість країн зросла до 41. Велика Британія виявила загалом 418 підтверджених випадків захворювання SARS-CoV-2 Каппа. 6 червня 2021 року група з 60 випадків, виявлених в австралійському місті Мельбурн, була пов’язана з варіантом Каппа. За даними GISAID у липні 2021 року, Індія надала більше генетичних зразків варіанту Каппа, ніж будь-яка інша країна.

Передача спільноти У технічному брифінгу з охорони здоров’я Англії від 22 квітня 2021 року повідомлялося, що в Англії було виявлено 119 випадків цього підваріанта з концентрацією випадків в районі Лондона та регіонах Північного Заходу та Сходу Англії. Із 119 випадків 94 мали встановлений зв’язок із подорожами, 22 випадки все ще перебувають у розслідуванні, але решта 3 випадків не мають жодного відомого зв’язку з подорожами.

2 червня The Guardian повідомила, що принаймні 1 з 10 випадків спалаху в австралійському штаті Вікторія були викликані контактом з незнайомими людьми, і що передача через громаду була пов’язана з кластерами варіанту Каппа. Проте експерт з інфекційних захворювань, професор Грег Дор, сказав, що варіант Каппа поводиться «так само, як ми бачили раніше» по відношенню до інших варіантів в Австралії.

Ефективність вакцини

Вакцини ефективні проти варіанту Каппа, хоча і в меншій мірі, ніж проти вихідного штаму.

Дослідження, проведене Оксфордським університетом у червні 2021 року, показало, що вакцина Oxford-AstraZeneca та вакцина Pfizer-BioNTech були ефективними проти варіантів Kappa та Delta, що свідчить про те, що поточні вакцини забезпечують захист від цих варіантів, хоча й з незначним зниженням нейтралізації.

Коваксин також був визнаний ефективним проти варіанту Каппа (B.1.617.1), як і для інших варіантів.

Вакцина Moderna від COVID-19 також виявилася ефективною проти варіанту Каппа, хоча й із зменшенням нейтралізації в 3,3-3,4 рази.

Статистика +Cases by country (Updated as of 13 September 2021) GISAIDCountryConfirmed casesCollection date4,43726 May 202154531 May 202130824 June 202137212 May 20212068 June 202112815 June 202110222 June 20215913 May 20212831 May 20212712 June 2021277 May 2021620 April 20211620 May 20211713 May 20211318 April 2021717 May 20211227 April 2021104 May 202194 May 20211924 May 2021810 April 202172 June 20211518 June 20211123 May 20211026 April 2021519 May 2021517 April 2021520 April 2021729 April 202144 May 2021425 April 202142 June 202148 April 202141 June 2021229 April 2021210 March 202129 May 202123 April 202121 August 2021123 April 202116 April 2021119 April 202126 April 2021126 April 2021126 March 202112 May 202115 May 2021122 April 2021316 April 202116 May 2021112 March 2021210 February 202122 January 2021114 April 2021111 April 2021114 April 2021216 May 2021121 April 202118 November 2021World (58 countries)Total: 6,476Total as of 13 September 2021

Див. також

Штами SARS-CoV-2: Cluster 5, Альфа, Бета, Гамма, Дельта, Епсилон, Зета, Тета, Ета, Йота, Лямбда, М'ю, Омікрон

Примітки