Muzeum Wignacourta – muzeum w Rabacie na Malcie. Mieści się w XVIII-wiecznym barokowym budynku, który był siedzibą kolegium ówczesnej kolegiaty św. Pawła (dziś bazylika), a nazwane jest na cześć wielkiego mistrza Alofa de Wignacourt, który rządził wyspami maltańskimi w latach 1601–1622.
Muzeum połączone jest z grotą św. Pawła, gdzie, według powszechnej wiary, św. Paweł Apostoł zatrzymał się po katastrofie okrętu, który wiózł go do Rzymu, jak również z kilkoma podziemnymi kompleksami grzebalnymi oraz schronami przeciwlotniczymi z okresu II wojny światowej. Jego kolekcja koncentruje się głównie na eksponatach związanych ze sztuką oraz religią.
Historia thumb|Muzeum ma połączenie z grotą św. Pawła Grota św. Pawła jest to grota, w której, jak powszechnie się wierzy, przebywał św. Paweł Apostoł po katastrofie okrętu, który wiózł go do Rzymu. Grota znajduje się pod bazyliką św. Pawła. Na początku XVII wieku grota stała się popularnym celem pielgrzymek;