8 sierpnia Fopp wraz z grupą konspiratorów uciekł do Warszawy.
Służba w Armii Krajowej, powstanie warszawskie W Warszawie Fopp podjął się pracy jako kierowca w sklepie Braci Pakulskich. Jednocześnie powrócił do nauki w ramach tajnych kompletów. W 1944 roku uzyskał świadectwo dojrzałości.
Poprzez osoby znane mu z Włocławka, nawiązał kontakt ze środowiskiem Armii Krajowej. Miejscem, gdzie spotykali się konspiratorzy było mieszkanie Włodzimierza Sirocińskiego przy ul. Nowogrodzkiej 27. Sirociński był wujem żołnierza AK i byłego kolegi Foppa ze Szkoły im. Długosza, Konrada Kierkowskiego. Mieszkały tam też jego matka Helena i siostra Alina, również zaangażowane w ruch konspiracyjny. Sam Sirociński także pochodził z Włocławka.
W drugiej połowie 1943 roku Zbigniew Rawin-Roessler wprowadził Tadeusza Foppa do oddziału do zadań specjalnych AK o nazwie „Agat”. Oddział zmienił później nazwę na „Pegaz”, a później – „Parasol”. Był starszym strzelcem 1. plutonu 1. kompanii. Początkowo Fopp służył w zespole Moto, zajmującym się przede wszystkim zdobywaniem niemieckich samochodów. Brał też udział w wykonywaniu wyroków śmierci, w tym w słynnej, choć nieudanej Akcji „Koppe”, odbytej w Krakowie – był zapasowym kierowcą tej akcji. W drodze powrotnej wziął udział w potyczce pod wsią Udórz.