Działalność pro-palestyńska W październiku 2023 opublikowała w mediach społecznościowych zdjęcie ze swoich cotygodniowych piątkowych protestów klimatycznych, na którym wraz z trzema innymi uczestnikami trzymała transparenty. Jeden z nich głosił „Climate justice now” (pol. „Sprawiedliwość klimatyczna teraz!”, a pozostałe wyrażały poparcie dla Palestyńczyków w Strefie Gazy w kontekście wojny w tym regionie. W poście w serwisie X i Instagramie zamieściła również czternaście linków do kont wspierających „solidarność z Palestyną”, informując, że można tam znaleźć wskazówki, jak pomagać.
Spotkała się z krytyką za brak wyraźnego potępienia ataków z 7 października. W kolejnym poście napisała, że jest przeciwko „straszliwym atakom ze strony Hamasu” i podkreśliła potrzebę natychmiastowego zawieszenia broni oraz ochrony cywilów. Ministerstwo Edukacji Izraela zareagowało, usuwając z programu nauczania odniesienia, które przedstawiały Thunberg jako wzór do naśladowania i źródło inspiracji dla młodzieży, ze względu na początkowe posty wspierające Gazę bez jednoznacznego potępienia Hamasu.