Od 27 października 1869 do 23 października 1872 pracował jako lekarz miejski w Ostrowcu. Dodatkowo, 19 listopada 1870 roku został wyznaczony do tymczasowego pełnienia funkcji lekarza powiatowego w Iłży, z powodu choroby dotychczasowego lekarza Zieleńskiego.
Naczelny lekarz Szpitala św. Antoniego we Włocławku Pod koniec 1872 roku osiedlił się we Włocławku. Tu objął funkcję naczelnego lekarza, a później ordynatora Szpitala św. Antoniego. W tym czasie szpital ten posiadał 45 łóżka szpitalne i zatrudniał tylko jednego lekarza. Gruell wprowadził innowacyjne jak na owe czasy metody leczenia, np. leczenie ran kwasem karbolowym, zastosowanie opaski Esmarcha, a później opaski elastycznej przy amputacjach, watowego opatrunku Guerina na kikuty oraz w leczeniu wrzodów goleni. Podejmował się m.in. trudnych operacji nowotworów. Z uwagi na zły stan techniczny szpitala, który założono w 1823 roku w budynkach dawnego browaru, apelował do władz miasta o budowę nowego gmachu szpitala. Prośba ta nie została zrealizowana za jego życia. 3 czerwca 1905 roku dr Mieczysław Gruell zwolnił się ze stanowiska ordynatora, a jego następcą został jego dotychczasowy asystent dr Kraszewski.