Polska bierze udział w misji patrolowania przestrzeni powietrznej trzech państw bałtyckich w ramach misji Baltic Air Policing.
Gospodarka Według danych z 2025 roku wartość obrotów handlowych osiągnęła wartość ponad 2,3 mld euro z saldem dodatnim po stronie Polski (wartość polskiego eksportu do Estonii wyniosła prawie 1,6 mld euro). W 2025 roku Polska zajęła 5. miejsce wśród partnerów importowych Estonii.
+ Wymiana handlowa między Polską a Estonią w latach 2019-2024 (mld EUR) Rok 2021 2022 2023 2024 2025 Obroty handlowe 1,83 2,28 2,24 2,33 2,32 Eksport z Polski 1,26 1,64 1,62 1,68 1,58 Import z Estonii 0,57 0,64 0,62 0,65 0,74 Saldo 0,69 1,0 1,0 1,03 0,,84
Wartość polskich bezpośrednich inwestycji zagranicznych (według danych na koniec 2024 roku) wyniosła 241,5 mln EUR, natomiast estońskich inwestycji w Polsce – 779,4 mln EUR.
Społeczeństwo, kultura i nauka Podstawą współpracy obu państw w zakresie nauki i kultury jest umowa międzyrządowa z 1992 roku.
Uniwersytet Talliński i Uniwersytet w Tartu prowadzą lektoraty języka polskiego.