W terenie organizacja scaleniowa początkowo ograniczyła się do stworzenia lokalnych sztabów, jednocześnie scalanie oddziałów przebiegało powoli, gdyż każda z organizacji (szczególnie FTPZgodnie z dyrektywą dowództwa FTP z 14 lipca 1944 na opaskach stanowiących często jedyny symbol identyfikujących Ruch Oporu obok krzyża lotaryńskiego i skrótu umieszczano skrót // lub czapkę wolności (dużo rzadziej czerwoną gwiazdę).) dążyła do maksymalnego zachowania autonomii i jej podkreślenia.
Organizacje tworzące FFI thumb|Sztandar 2 kompanii 1 Batalionu FFI z Finistère
W skład Francuskich Sił Wewnętrznych weszły wszystkie istniejące dotychczas organizacje Ruchu Oporu, m.in.: Tajna Armia (Armée Secrète, AS) – powstała we wrześniu 1944 wierna generałowi de Gaulle’owi organizacja wojskowa stworzona z połączenia prawicowej Walki i lewicowych Wyzwolenie-Południe (Libération-Sud) i Wolnych Strzelców (Franc-Tireur) ze strefy południowej. Kierownictwo polityczne nad AS sprawował Ruch Zjednoczenia Ruchu Oporu (MUR). Swoje działania rozszerzyła na zachodnie departamenty strefy okupowanej. Wolni Strzelcy i Partyzanci (Francs-Tireurs et Partisans, FTP) – powstała w marcu 1942 organizacja wierna Frontowi Narodowemu na Rzecz Walki o Wyzwolenie i Niepodległość Francji (koalicja francuskiej skrajnej lewicy z częścią lewicy).