W 1996 przejęło ono nadzór nad środowiskowymi agencjami dotąd zarządzanymi przez ministerstwo finansów. W 2000 powołano Federalne Ministerstwo Rolnictwa, Leśnictwa, Środowiska i Gospodarki Wodnej, kierowane przez dotychczasowego ministra rolnictwa i leśnictwa Wilhelma Molterera. W 2018 rozszerzono zakres jego kompetencji o kwestie energetyki, górnictwa i turystyki, zmieniając nazwę na Federalne Ministerstwo Zrównoważonego Rozwoju i Turystyki. Na początku 2020 zmieniono na nowo nazwę ministerstwa na Federalne Ministerstwo Rolnictwa, Regionów i Turystyki. W jego kompetencjach pojawiła się telekomunikacja i poczta, natomiast kwestie klimatu i środowiska (bez leśnictwa i gospodarki wodnej) przeniesiono do nowego Federalnego Ministerstwa Ochrony Klimatu, Środowiska, Energii, Mobilności, Innowacji i Technologii. 18 lipca 2022 r.