Ostatecznie Bayern przegra w serii rzutów karnych 5:6.
3 sierpnia 2019 roku, Bayern Monachium rozpoczął sezon oficjalny od meczu o Superpuchar Niemiec z Borussią Dortmund. Bayern przegrał to spotkanie 0:2 i stracił szansę na pierwsze trofeum w sezonie.
16 sierpnia 2019 roku, Bayern rozpoczął zmagania ligowe od meczu z Hertha BSC. Ostatecznie padł remis 2:2 i Bayern stracił punkty już na otwarcie sezonu. W kolejnych meczach Bawarczycy poradzili sobie już lepiej pokonując 3:0 FC Schalke 04 i 6:1 1. FSV Mainz 05. Następnie padł remis 1:1 w meczu z RB Lipsk. W kolejnej kolejce podopieczni Kovača pokonali 4:0 beniaminka 1. FC Köln. Następnie Bayern zmierzył się z kolejnym beniaminkiem SC Paderborn 07. Ostatecznie Bawarczycy wygrali to spotkanie 3:2. W kolejnej kolejce Bayern Monachium przegrał 1:2 z [TSG Hoffenheim. W kolejnym meczu podopieczni Niko Kovača zremisowali 2:2 z FC Augsburg. Serie niepowodzeń przerwało zwycięstwo 2:1 z ostatnim z beniaminków Unionem Berlin. W następnej kolejce nastąpiło jednak duże rozczarowanie. Bayern został pokonany, wynikiem aż 1:5, przez Eintracht Frankfurt. Kolejne dwa spotkania, pod wodzą już nowego trenera Hansa-Dietera Flicka, zakończyły się zwycięstwami Bayernu 4:0 z Borussią Dortmund i tym samym wynikiem z Fortuną Düsseldorf.