Edukacja seksualna powinna być dostosowana do wieku, stopnia rozwoju młodych osób i zdolności rozumienia, a także do kultury, z jakiej się wywodzą, uwzględniając społeczno-kulturową tożsamość płci. Powinna też odnosić się do rzeczywistej sytuacji, w jakiej żyją młodzi ludzie. Edukacja seksualna oparta jest na prawach człowieka (seksualnych i reprodukcyjnych). Edukacja seksualna oparta jest na koncepcji holistycznie rozumianego dobrostanu, w tym zdrowia. Edukacja seksualna jest trwale oparta na równości płci, samostanowieniu i akceptacji różnorodności. Edukacja seksualna rozpoczyna się w momencie narodzin. Edukację seksualną należy rozumieć jako wkład w kierunku sprawiedliwego i samostanowiącego społeczeństwa, zarówno w odniesieniu do jednostek, jak i wspólnoty. Edukacja seksualna oparta jest na aktualnych/sprawdzonych informacjach naukowych.
Co więcej, według WHO, podczas prowadzenia zajęć z edukacji seksualnej należy pamiętać o poniższych zasadach:
Edukacja seksualna powinna odbywać się w sposób interaktywny.