Organizacją procesu przyznawania nagrody zajmuje się Wojewódzka i Miejska Biblioteka Publiczna im. Josepha Conrada-Korzeniowskiego w Gdańsku.
Kategorie Pomorską Nagrodę Literacką przyznaje się w trzech kategoriach:
Literacka Książka Roku – oceniane są utwory należące do szeroko rozumianej literatury pięknej Pomorska Książka Roku – oceniane są wszelkie publikacje związane tematycznie z regionem, zarówno literackie, jak i inne np. opracowania historyczne, monografie, biografie, studia regionalne, przewodniki, albumy, rozprawy naukowe Całokształt pracy literackiej – ocenie podlega dorobek pracy twórczej: jego wartość intelektualna, artystyczna, oddziaływanie krajowe, znaczenie dla regionu, bądź dokonania w dziedzinach pozaliterackich: edukacji, życiu kulturalnym i społecznym oraz popularyzacji literatury, książki lub czytelnictwa
W 2022 r. po raz pierwszy przyznano Nagrodę Publiczności. Wybierać można było spośród nominowanych książek. W plebiscycie internetowym oddano 183 głosy.