Kariera trenerska Matjaž Kopitar jeszcze w trakcie kariery sportowej rozpoczął karierę trenerską, gdyż w latach 2001–2003 był grającym trenerem HK Maribor, a po zakończeniu kariery sportowej w 2003 roku, w latach 2003–2004 był asystentem Gorazda Drinovca w reprezentacji Słowenii U-18 podczas mistrzostw świata Dywizji 1A w austriackim AmstettenSłovenia - Team Roster 2004 WC18 D1A – IIHF.com , na których reprezentacja Słowenii U-18 zajęła 2. miejsce.

Następnie w latach 2003–2005 oraz 2006–2008 był asystentem selekcjonerów Kari Savolainena, Teda Satora oraz Matsa Waltina w seniorskiej reprezentacji Słowenii, a w latach 2011–2015 był jej głównym trenerem, która pod wodzą Kopitara w 2014 roku najpierw dotarł do ćwierćfinału turnieju olimpijskiego w Soczi oraz na mistrzostwach świata I Dywizji Grupy A w Korei Południowej wywalczył do mistrzostw świata 2015 Elity w Czechach, na których jego drużyna zajęła w Grupie B ostatnie – 8.