megacephalus, które wydają się reprezentować morfologicznie ukryte gatunki: klad zachodni (podgatunki ambiguus, californicus, medius i oregonus), klad Idaho (atrirelictus), klad środkowy (megacephalus, polionotus i sabulonis) oraz klad wschodni (albiventer, leucotis i paululus). W obrębie gatunku wyróżnianych jest dwanaście podgatunków.
Kariotyp Garnitur chromosomowy tego zwierzęcia tworzy 20 par (2n=40) chromosomów (FN=74), ale u odskoczków ciemnych z podgatunków M. m. medius i M. m. californicus FN=76.
Etymologia Microdipodops: mikros „mały”; rodzaj Dipodops (szczuroskoczek). megacephalus: gr. μεγας megas „wielki”; -κεφαλος -kephalos „-głowy”, od κεφαλη kephalē „głowa”. albiventer: „biały”; venter, ventris „brzuch”. ambiguus: łac. ambiguus „wątpliwy, niepewny”, od ambigere „wątpić”, od przyimka ambi- „wokół”; agere „wprawić w ruch”. atrirelictus: łac. ater „czarny, ciemny”; relictus „reliktowy, odosobniony”, od relinquere „zostawić w tyle”. californicus: Kalifornia. leucotis: gr. λευκος leukos „biały”; -ωτις -ōtis „-uchy”, od ους ous, ωτος ōtos „ucho”. medius: łac. medius „pośredni, środkowy”. nexus: łac. nexus „związanie, splot”. oregonus: Oregon, Stany Zjednoczone. paululus: łac. paululus „bardzo mały”, od paulus „mały”; przyrostek zdrabniający -ulus. polionotus: gr.