Sztandar szkoły Szkoła po raz pierwszy otrzymała swój sztandar 25 czerwca 1966 roku. Niedużo wcześniej, bo 20 kwietnia 1966, szkoła otrzymała patronat wybitnego polskiego kompozytora, dyrygenta, pedagoga i wirtuoza organów – Feliksa Nowowiejskiego. Wybór takiego patrona był uzasadniony jego związkami z Warmią (ur. się w Barczewie k. Olsztyna). Wówczas również szkoła została odznaczona Medalem Tysiąclecia Państwa Polskiego i Złotą Odznaką za zasługi dla krajuIKAT. Gazeta braniewska, 18 lutego 2011, dodatek Feliks na dziś, luty 2011, Święto patrona i nowy sztandar, s. 9.
21 stycznia 2011, w dniu obchodów święta patrona szkoły, Liceum Ogólnokształcące otrzymało nowy sztandar, którego fundatorem były władze miasta i lokalne przedsiębiorstwa. Sztandar został poświęcony przez proboszcza Leszka Galicę podczas uroczystej mszy św. w Bazylice św. Katarzyny Aleksandryjskiej.