Struktura Gen F12 czynnika XII znajduje się na końcu długiego ramienia piątego chromosomu (5q33-qter). Ludzki czynnik XII zbudowany jest z 596 aminokwasów o łącznej masie cząsteczkowej około 80 kD, ułożonych w dwa łańcuchy (ciężki i lekki), połączone wiązaniem dwusiarczkowym. Łańcuch ciężki zawiera dwie domeny typu fibronektyny (typ I i II), dwie domeny podobne do naskórkowego czynnika wzrostu, domenę kringle i region bogaty w prolinę, a łańcuch lekki zawiera domenę proteazy. Struktura domeny tandemowej (FnI-EGF-podobnej) czynnika krzepnięcia XII została określona za pomocą krystalografii rentgenowskiej. Struktury krystaliczne łańcucha lekkiego FXII występują jako niezwiązane (β-FXII) i związane (β-FXIIa) z inhibitorami.
Przeciętne stężenie FXII w osoczu wynosi 30 mg/l.
Rola w patologii Niedobór czynnika XII jest rzadkim zaburzeniem dziedziczonym autosomalnie recesywnie. Zaburzenie to można nabyć lub odziedziczyć. Najczęściej zachodzi dziedziczenie wadliwych genów od obojga rodziców. Osoby z tylko jedynym wadliwym genem mogą mieć niższy poziom czynnika XII w osoczu, a także mogą przekazywać wadliwy gen połowie swego potomstwa. U osób z wrodzonym niedoborem czynnika XII stan taki utrzymuje się przez całe życie.