Departament Altstöttera był odpowiedzialny za ustawy norymberskie, który miały za zadanie odizolować Żydów od Niemców czystej krwi i odebrać im prawa cywilne. Jego departament był również odpowiedzialny za niemieckie prawo dziedziczenia, które sprawiało, że majątek Żydów po śmierci nie trafiał do ich dzieci, ale do rządu niemieckiego.
Członkostwo w organizacjach nazistowskich Zanim zostało przejęte przez NSDAP, Altstötter należał do Stahlhelm, czyli stowarzyszenia weteranów. Po tym jak ta organizacja została przejęta przez nazistów Altstötter dołączył do SA. W dniu 15 maja 1937 został przeniesiony z SA do SS, gdzie w 1944 otrzymał rangę SS-Oberführera. We wrześniu 1938 wstąpił do NSDAP. Josef Altstötter miał bliski kontakt z wysokiej rangi oficerami SS z czego najważniejsi to Heinrich Himmler, Ernst Kaltenbrunner i Gottlob Berger.