Podobnie mieszanie utwór ocenił Tomasz Gardziński ze Spider's Web, przyznając Imperium chmur ocenę 6/10. Chwalił poetyckość prozy, ambitną problematykę, kreację młodych bohaterów oraz konsekwencję, z jaką Dukaj realizował eksperymentalną koncepcję utworu. Krytycznie oceniał natomiast niedostateczne rozwinięcie elementów historii alternatywnej i konsekwencji wykorzystania technologii Geista, a także sposób wykorzystania postaci przejętych z Lalki. Jego zdaniem utworu może silnie polaryzować odbiorców, a całość pozostawia „bardzo mieszane uczucia”.
Krytycznie książkę oceniła Sara Manasterska z „Dwutygodnika”. Mimo docenienia ogromu pracy przygotowawczej Dukaja i ilości zgromadzonego materiału zarzuciła powieści liczne błędy językowe i historyczne dotyczące Japonii, stereotypowe i orientalizujące przedstawienie oraz nieudaną próbę przyjęcia japońskiej perspektywy narracyjnej. Krytycznie oceniła również refleksję nad relacją między językiem a systemem pisma, uznając ją za naiwną i egzotyzującą.
Pozytywnie książkę ocenił Tymoteusz Wronka z portalu NaEKRANIE, przyznając Imperium chmur ocenę 8/10. Określił utwór jako skomplikowany, wielowymiarowy i wymagający od czytelnika skupienia, uznał jednak, że wysiłek interpretacyjny przynosi satysfakcjonujący rezultat.