W pierwszym etapie zadaniem drużyny było zdobycie 5 kluczy, które otworzą bramę skarbca. Można było je zdobyć wykonując zadania sprawnościowe, manualne i wymagające dużej aktywności fizycznej (kilka – około siedmiu–ośmiu), a także logiczne, w tym rozwiązując zagadki zadawane przez Janusza Weissa (dwukrotnie w odcinku). Czas na wykonanie każdego zadania odmierzały klepsydry; wynosił około 2–3 minut. Jeżeli zawodnik nie zdążył opuścić komnaty, w której wykonywał zadanie przed upływem wyznaczonego czasu, niezależnie od tego, czy zdobył klucz, czy nie, stawał się „więźniem Fortu Boyard” i nie uczestniczył w kolejnych zadaniach tego etapu. Jeżeli drużynie nie udało się zdobyć 5 kluczy, to mogli je dokupić za cenę skrócenia finału o 15 sekund. Jeżeli drużyna zdobyła więcej niż 5 kluczy, nadliczbowe klucze wymieniano na dodatkowe wskazówki naprowadzające na hasło w finale.
W etapie drugim zadaniem zawodników było zdobycie jak największej liczby rulonów ze słowami-wskazówkami. Jedną można było je zdobyć na wieży zagadek, a kolejne dwie, wykonując zadania wymagające większej sprawności fizycznej i odwagi.