W lipcu 1919 roku ks. Pączek został administratorem parafii św. Jakuba. Jesienią przeprowadził się do Poznania, gdzie powstawał 66 Kaszubski Pułk Piechoty. Został kapelanem pułku. 18 stycznia 1920 roku wkroczył z nim do Torunia. Brał udział w wojnie polsko-bolszewickiej, na front wyruszył 3 czerwca 1920 roku.
Był również przez krótki okres proboszczem garnizonowym parafii św. Katarzyny w Toruniu.
W kwietniu 1921 roku przeniósł się do Grudziądza. Tam został katechetą w Państwowym Gimnazjum Matematyczno-Przyrodniczym. Działał w grudziądzkim Obywatelskim Komitecie Plebiscytowym dla plebiscytu na Warmii i Mazurach. Współtworzył Związek Filomatów Pomorskich (ZFP). 24 sierpnia 1922 roku został wybrany na sekretarza zarządu grudziądzkiej grupy terenowej. Jako filomata uczestniczył w inicjatywie wojewody pomorskiego Jana Brejskiego (wówczas członka komitetu honorowego ZFP), wspierającej finansowo Pomorzan studiujących w Uniwersytecie Poznańskim oraz budowę pomorskiej bursy akademickiej w Poznaniu. Interesował się działalnością związków i stowarzyszeń zrzeszających inteligencję pomorską.