Pracując nieprzerwanie w WSP (później na Uniwersytecie Gdańskim), uzyskał w 1967 stopień doktora, w 1975 stopień doktora habilitowanego, w 1986 tytuł profesora nadzwyczajnego, a w 1993 profesora zwyczajnego. W latach 1972–2004 był również nauczycielem akademickim w Akademii Muzycznej im. Stanisława Moniuszki w Gdańsku.
W 1987 został członkiem Zarządu Głównego Gdańskiego Towarzystwa Przyjaciół Sztuki. W 1998 otrzymał tytuł doktora honoris causa Uniwersytetu w Linköping.
Był mężem Aleksandry z domu Horbowskiej.
Zmarł w Gdańsku, pochowany 2 sierpnia 2021 na cmentarzu Łostowickim (kwatera 116-6-4).
31 stycznia 2024 odbyła się uroczystość przekazania spuścizny prof. Lecha Mokrzeckiego do zasobu Archiwum Uniwersytetu Gdańskiego.
Pełnione funkcje w Uniwersytecie Gdańskim Wicedyrektor Instytutu Pedagogiki (1978–1981) Dyrektor Instytutu Pedagogiki (1981–1991) Kierownik Zakładu Historii Nauki, Oświaty i Wychowania (1984–2005) Prorektor (1985–1987)