W prologu autor przedstawił zamiar ogólnego opisania zasad chemicznych, które stosował przez 55 lat badań rozwiązując różne problemy geologiczne, od mineralogii siarczków żelaza, przez chemiczne przemiany węglanów w oceanach, chemię powierzchni minerałów krzemianowych, przemiany biogeochemiczne zachodzące w czasie procesów wczesnej diagenezy, procesy kształtowania się fitocenoz uczestniczących w wietrzeniu itp. Wyniki wielu różnorodych pomiarów umożliwiły podjęcie prób identyfikacji systemu Ziemi i opracowania matematycznych modeli zmian stężenia atmoferycznego tlenu i dwutlenku węgla w atmosferze.
Wyniki pomiarów terenowych i laboratoryjnych oraz dane proxy R. Berner od wczesnych lat 1980. wykorzystywał tworząc matematyczne modele procesów zachodzących na Ziemi w fanerozoiku. Modele umożliwiają prognozowanie kierunków i szybkości zmian zachodzących współcześnie, np. tworzenie modeli klimatycznych opartych na modelowaniu obiegu węgla, tlenu i innych pierwiastków w przyrodzie.
Publikacje Zakres modelowania ilustrują tytuły części publikacji z lat 1984–2006 (R.