Odbiór gry Bloons TD 6 otrzymała przeważnie pozytywne recenzje od krytyków. Stephen Knightly, sekretarz NZ Game Developers Association, pochwalił głębię rozgrywki, wskazując na atrakcyjną oprawę wizualną i przystępność gry dla szerokiego grona odbiorców, a jednocześnie podkreślając jej złożoność, która może zainteresować bardziej doświadczonych graczy. W swojej wypowiedzi zaznaczył: „Jest zabawna i przyjazna, przez co jest przystępna, ale pod powierzchnią jest dość skomplikowana”. Choć gra została doceniona za różnorodność rozgrywki, krytykowano ją za brak możliwości bezpłatnego powtarzania poziomów.
Harry Slater z Pocket Gamera uznał, że rozgrywka zbyt mocno przypomina poprzednie części serii, co może nie zadowolić graczy poszukujących dłuższego zaangażowania. Z kolei Dennis Zirkler z niemieckiego serwisu GameStar stwierdził, że zawartość gry jest wystarczająco rozbudowana, by wspierać różne style gry, jednocześnie zachowując podstawową różnorodność. Wskazał również, że mikrotransakcje w grze mają charakter opcjonalny i nie wpływają znacząco na satysfakcję z rozgrywki. Krytycznie odniósł się natomiast do konieczności wielokrotnego przechodzenia gry w celu odblokowania nowych map, jednocześnie chwaląc tryb „CHIMPS” za ograniczenie powtarzalnych strategii i wymuszenie bardziej zróżnicowanego podejścia.