Po przejęciu Kia Motors przez Hyundai Motor Group, zdecydowano się zbudować z myślą o rynku Korei Południowej i Indonezji bliźniaczy wobec Atosa model Kia Visto, który jednakże uzyskał przemodelowaną bryłę nadwozia i inny wygląd tylnego pasa.
Pierwotnie samochód miał trafić do sprzedaży również w Europie, jednak ostatecznie zdecydowano się nazwać go Atos Prime i uzupełnić ofertę jako droższy, lepiej wyposażony wariant oferowany równolegle z klasycznym Atosem.
Hyundai Atos Prime od pierwowzoru odróżniał się niższym o 35 centymetrów nadwoziem z opadającą linią dachu, a także pochyloną pod większym kątem tylną szybą i bardziej ściętymi słupkami C. Tylne lampy umieszczono niżej, nadając im bardziej ściętą formę. Pod kątem cenowym, na polskim rynku wariant Prime od podstawowego Atosa był droższy o ok. 2 tys. złotych.
Lifting Restylizacja, jaką Atos Prime przeszedł w 2001 roku razem z tańszym Atosem, przyniosła dla niego obszerniejsze zmiany. Poza nowym wyglądem atrapy chłodnicy i nowym kolorem kierunkowskazów w reflektorach, zmienił się także wygląd oraz układ lamp tylnych.