Od 1895 r. wody Wapienicy, podobnie jak wody jej prawobrzeżnego dopływu, Żydowskiego Potoku, pobierane z pięciu ujęć, zasilały wybudowanym wodociągiem Bielsko. W 1932 r. w jej górnym biegu, w Dolinie Wapienicy, wybudowano zaporę. Zbiornik powstały w wyniku wybudowania zapory nosi nazwę Jezioro Wielka Łąka.
W zbiorniku żyją pstrągi, a poniżej zbiornika głowacze. Wędkować można od źródeł do rzeki Iłownica, dozwolone przynęty sztuczne zgodnie z regulaminem PZW Katowice.
W górnym biegu (do sztucznego zbiornika) rzeka prowadzi wody I klasy czystości. Poniżej oczyszczalni ścieków „Beskidiana” prowadzi wodę III klasy czystości.
Wapienica jest rzeką charakteryzującą się nagłymi przyborami, występującymi w wyniku nawalnych opadów nawiedzających często północne stoki Beskidu Śląskiego. W 1972 r. na stacji IMGW Podkępie, pomiędzy Ligotą a Czechowicami-Dziedzicami, zanotowano rekordowy poziom wody wynoszący 580 cm. Na początku czerwca 2024 r., w trakcie ulewnych deszczów, rekord ten został pobity: stan wód rzeki wzrósł w ciągu jednej doby z 229