Względna siła oddziaływań magnetycznych i a więc także dynamika całego systemu, zależy silnie od zewnętrznego pola magnetycznego. Przykładowo w klasycznym MRJ jest zazwyczaj większa niż 1 T, więc częstotliwość Larmora dla 1H jest większa niż 10 MHz. Jest więc znacznie większa niż częstotliwość (siła) sprzężenia które zazwyczaj zawierają się w przedziale od kilku do kilkuset Hz. W tym zakresie jest zaburzeniem dla Przeciwnie dla pól z zakresu nanotesli – częstotliwości Larmora mogą być znacznie mniejsze niż sprzężenia a wtedy dominuje dynamikę oddziaływania.
Polaryzacja Ponieważ siła sygnału MRJ jest proporcjonalna do magnetyzacji spinowej ośrodka, zanim sygnały pochodzące od spinów mogą zostać wykryte eksperymentalnie, należy spolaryzować układ spinów jądrowych. Istnieje wiele metod polaryzacji. Najprostsza polega na zwykłym, termodynamicznym uporządkowaniu spinów w zewnętrznym polu magnetycznym, na drodze oddziaływania zeemanowskiego. Następnie dokonuje się względnie szybkiego transferu próbki w niskopolowy obszar detekcji. Uzyskana w ten sposób polaryzacja jest jednak bardzo niewielka i nawet przy wykorzystaniu silnego pola rzędu 1 T jest rzędu 10−6.