S. Bornbach podjął się badań nad historią Gdańska. Gromadząc dokumenty i kroniki, opracował historię buntu gdańskiego w latach 1522–1526 ("Historia vom Auffruhr zu Dantzig welcher sich angefangen hatt Anno 1522 und ist durch Königl[iche] Maj[estät] von Pohlen Anno 1526 gestillet mit allem Fleiss beschrieben durch Stenzel Bornbach [...]"). Był autorem Kroniki Weinreicha, kroniki Prus w wersjach krótszej i obszernej (Cronica des Landes zu Preussen), dzienników wojennych w 1577 (Kriegs-Journal de Anno 1577, wyd. 1904). Jego dorobek naukowy obejmował także siedmiotomowy zbiór recesów zjazdów krajowych i hanzeatyckich w latach 1374–1524 (Sammlung von Preußischen Landtags- und Hansa-Recessen). W swoich badaniach skupił się również na genealogii gdańskich rodzin patrycjuszowskich (Collectanea Genealogica Prussica). Opisał wojnę Rzeczypospolitej z Gdańskiem 1576-1577 w dziele „Geschichte des Krieges zwischen dem Königs Stephano und der Stadt Dantzig Ao 1577” wznowionym przez wydawnictwo W.