Flora thumb|left|Roślinność halofitowa na równinach wokół jeziora Natron Jeziora są pozbawione roślinności makrofitowej, ale są bardzo bogate w sinice, takie jak Spirulina, zabarwiające wodę jezior na kolor czerwony do pomarańczowego. Słone błota bezpośrednio otaczające wody jezior są uważane za solniska i również pozbawione są roślinności makrofitowej. Zasiedlane są przez sinice, a także kilka gatunków roślin halofitycznych. Dominującymi gatunkami słonorośli są Cyperus laevigatus, gatunki z rodzaju Dactyloctenium, sit morski, Salvadora persica, Sporobolus spicatus, Sporobolus robustus, Suaeda monoica i Triplocephalum holstii. Nieco mniej zasadowe równiny otaczające jeziora są zdominowane przez trawy, krzewy z gatunku Sesbania sesban i rozproszone drzewa z gatunku Acacia xantophloea. Słonorośla otaczające jezioro Natron przechodzą w wulkaniczne stepy Serengeti na południu i w południowe zarośla akacjowo-balsamowcowe w pozostałych kierunkach. Solniska jeziora Bahi otoczone są w całości przez południowe zarośla akacjowo-balsamowcowe.